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高能物理研究所 589 近代物理研究所 286 西北高原生物研究所 285
合肥物质科学研究院 231 上海药物研究所 153 昆明植物研究所 139
地质与地球物理研究所 114 地理科学与资源研究所 108 化学研究所 104
广州地球化学研究所 80 云南天文台 79 中国科学院大学 77
国家天文台 73 金属研究所 69 物理研究所 62
大连化学物理研究所 62 地球化学研究所 62 西安光学精密机械研究所 60
海洋研究所 58 植物研究所 58 宁波材料技术与工程研究所 57
上海应用物理研究所 56 上海营养与健康研究所 54 生态环境研究中心 47
烟台海岸带研究所 47 长春光学精密机械与物理研究所 40 自动化研究所 40
半导体研究所 39 紫金山天文台 39 水生生物研究所 37
寒区旱区环境与工程研究所 35 上海生物化学与细胞生物学研究所 35 南海海洋研究所 34
过程工程研究所 33 上海光学精密机械研究所 32 动物研究所 31
成都山地灾害与环境研究所 30 沈阳应用生态研究所 30 武汉物理与数学研究所 28
深圳先进技术研究院 27 力学研究所 26 上海硅酸盐研究所 25
计算技术研究所 24 长春应用化学研究所 24 南京地理与湖泊研究所 22
沈阳自动化研究所 22 上海天文台 21 南京土壤研究所 21
上海技术物理研究所 20 理论物理研究所 19 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 19
青藏高原研究所 18 成都生物研究所 17 武汉病毒研究所 17
西双版纳热带植物园 16 数学与系统科学研究院 16 工程热物理研究所 16
遥感与数字地球研究所 15 心理研究所 15 武汉植物园 14
新疆天文台 14 上海微系统与信息技术研究所 11 地球环境研究所 11
武汉岩土力学研究所 10 重庆绿色智能技术研究院 9 福建物质结构研究所 8
南京地质古生物研究所 8 青岛生物能源与过程研究所 8 生物物理研究所 7
广州生物医药与健康研究院 7 光电技术研究所 7 软件研究所 7
青海盐湖研究所 6 新疆理化技术研究所 6 广州能源研究所 6
昆明动物研究所 6 古脊椎动物与古人类研究所 6 国家空间科学中心 5
上海神经科学研究所 5 亚热带农业生态研究所 4 兰州化学物理研究所 4
新疆生态与地理研究所 2 计算机网络信息中心 2 深海科学与工程研究所 2
国家授时中心 2 测量与地球物理研究所 1 东北地理与农业生态研究所 1
声学研究所 1 文献情报中心 1