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近代物理研究所 433 高能物理研究所 403 昆明植物研究所 267
上海药物研究所 210 合肥物质科学研究院 159 西北高原生物研究所 127
地质与地球物理研究所 124 半导体研究所 107 化学研究所 94
地理科学与资源研究所 84 自动化研究所 83 上海应用物理研究所 79
中国科学院大学 76 大连化学物理研究所 71 物理研究所 67
植物研究所 67 金属研究所 66 广州地球化学研究所 66
地球化学研究所 63 生态环境研究中心 57 海洋研究所 54
云南天文台 53 水生生物研究所 50 宁波材料技术与工程研究所 44
成都山地灾害与环境研究所 43 国家天文台 43 西安光学精密机械研究所 43
心理研究所 38 武汉物理与数学研究所 38 深圳先进技术研究院 36
沈阳应用生态研究所 36 过程工程研究所 34 动物研究所 32
遥感与数字地球研究所 30 南海海洋研究所 29 数学与系统科学研究院 29
武汉岩土力学研究所 29 西双版纳热带植物园 28 重庆绿色智能技术研究院 27
上海营养与健康研究所 25 上海天文台 23 寒区旱区环境与工程研究所 23
兰州化学物理研究所 23 上海硅酸盐研究所 22 计算技术研究所 21
武汉植物园 21 昆明动物研究所 21 广州生物医药与健康研究院 20
南京地理与湖泊研究所 18 上海光学精密机械研究所 18 理论物理研究所 17
青岛生物能源与过程研究所 17 力学研究所 16 长春应用化学研究所 16
紫金山天文台 16 南京地质古生物研究所 15 国家空间科学中心 13
上海生物化学与细胞生物学研究所 13 广州能源研究所 13 工程热物理研究所 13
成都生物研究所 12 青藏高原研究所 11 长春光学精密机械与物理研究所 11
新疆理化技术研究所 11 武汉病毒研究所 11 新疆天文台 10
古脊椎动物与古人类研究所 10 地球环境研究所 9 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 8
光电技术研究所 8 生物物理研究所 7 青海盐湖研究所 7
新疆生态与地理研究所 6 上海微系统与信息技术研究所 6 水土保持研究所 6
软件研究所 6 南京土壤研究所 5 烟台海岸带研究所 5
测量与地球物理研究所 4 深海科学与工程研究所 4 上海技术物理研究所 4
亚热带农业生态研究所 2 上海神经科学研究所 2 沈阳自动化研究所 2
国家授时中心 2 微电子研究所 1 上海有机化学研究所 1
声学研究所 1 南京天文光学技术研究所 1 文献情报中心 1
天津工业生物技术研究所 1