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高能物理研究所 707 近代物理研究所 414 上海药物研究所 344
西北高原生物研究所 289 地理科学与资源研究所 257 化学研究所 232
合肥物质科学研究院 229 金属研究所 176 中国科学院大学 148
昆明植物研究所 144 大连化学物理研究所 140 植物研究所 119
过程工程研究所 118 上海光学精密机械研究所 115 生态环境研究中心 114
物理研究所 113 地质与地球物理研究所 105 水生生物研究所 95
广州地球化学研究所 92 海洋研究所 91 自动化研究所 90
半导体研究所 86 云南天文台 84 深圳先进技术研究院 80
国家天文台 78 上海营养与健康研究所 75 西安光学精密机械研究所 71
地球化学研究所 59 动物研究所 59 沈阳应用生态研究所 59
光电技术研究所 58 宁波材料技术与工程研究所 57 计算技术研究所 55
兰州化学物理研究所 55 成都山地灾害与环境研究所 53 南京地理与湖泊研究所 52
心理研究所 50 上海硅酸盐研究所 50 沈阳自动化研究所 48
上海应用物理研究所 47 数学与系统科学研究院 46 上海生物化学与细胞生物学研究所 44
寒区旱区环境与工程研究所 42 西双版纳热带植物园 40 南海海洋研究所 36
紫金山天文台 34 力学研究所 32 长春光学精密机械与物理研究所 32
青岛生物能源与过程研究所 32 理论物理研究所 30 武汉植物园 29
武汉物理与数学研究所 28 上海天文台 27 新疆天文台 27
遥感与数字地球研究所 24 武汉岩土力学研究所 24 重庆绿色智能技术研究院 22
烟台海岸带研究所 22 古脊椎动物与古人类研究所 21 长春应用化学研究所 20
昆明动物研究所 20 新疆理化技术研究所 19 地球环境研究所 18
国家授时中心 18 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 17 武汉病毒研究所 16
国家空间科学中心 15 新疆生态与地理研究所 14 青海盐湖研究所 14
广州生物医药与健康研究院 13 广州能源研究所 13 生物物理研究所 12
南京地质古生物研究所 12 成都生物研究所 10 青藏高原研究所 8
南京土壤研究所 8 上海微系统与信息技术研究所 8 上海神经科学研究所 7
上海技术物理研究所 7 软件研究所 7 东北地理与农业生态研究所 6
深海科学与工程研究所 6 工程热物理研究所 5 福建物质结构研究所 4
亚热带农业生态研究所 3 城市环境研究所 3 科技战略咨询研究院 3
天津工业生物技术研究所 3 微电子研究所 2 声学研究所 2
文献情报中心 2 计算机网络信息中心 1 南京天文光学技术研究所 1