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高能物理研究所 1692 上海应用物理研究所 642 近代物理研究所 627
地理科学与资源研究所 390 福建物质结构研究所 381 长春光学精密机械与物理研究所 370
金属研究所 365 物理研究所 273 合肥物质科学研究院 209
云南天文台 160 国家天文台 137 寒区旱区环境与工程研究所 126
半导体研究所 120 化学研究所 119 长春应用化学研究所 118
上海药物研究所 97 南海海洋研究所 94 地球环境研究所 94
地质与地球物理研究所 92 紫金山天文台 84 上海生物化学与细胞生物学研究所 77
中国科学院大学 71 植物研究所 71 上海硅酸盐研究所 70
动物研究所 69 青藏高原研究所 65 昆明动物研究所 63
南京地质古生物研究所 59 昆明植物研究所 59 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 48
上海天文台 48 宁波材料技术与工程研究所 45 理论物理研究所 44
上海微系统与信息技术研究所 43 大连化学物理研究所 42 深圳先进技术研究院 40
广州地球化学研究所 40 上海技术物理研究所 39 心理研究所 37
新疆天文台 36 国家空间科学中心 35 沈阳应用生态研究所 34
工程热物理研究所 33 力学研究所 31 西安光学精密机械研究所 31
兰州化学物理研究所 31 亚热带农业生态研究所 27 自动化研究所 27
武汉植物园 24 上海光学精密机械研究所 24 过程工程研究所 22
生态环境研究中心 22 水生生物研究所 21 数学与系统科学研究院 20
海洋研究所 20 西北高原生物研究所 19 天津工业生物技术研究所 19
青岛生物能源与过程研究所 18 新疆生态与地理研究所 17 东北地理与农业生态研究所 17
成都生物研究所 16 计算技术研究所 15 烟台海岸带研究所 14
新疆理化技术研究所 13 上海营养与健康研究所 13 南京土壤研究所 12
武汉物理与数学研究所 12 古脊椎动物与古人类研究所 12 西双版纳热带植物园 11
沈阳自动化研究所 11 广州能源研究所 11 成都山地灾害与环境研究所 10
遥感与数字地球研究所 10 微电子研究所 10 南京地理与湖泊研究所 9
地球化学研究所 9 上海神经科学研究所 8 重庆绿色智能技术研究院 8
广州生物医药与健康研究院 7 光电技术研究所 7 武汉岩土力学研究所 7
山西煤炭化学研究所 6 武汉病毒研究所 6 深海科学与工程研究所 6
水土保持研究所 6 城市环境研究所 4 软件研究所 4
国家授时中心 2 生物物理研究所 1 测量与地球物理研究所 1
南京天文光学技术研究所 1 华南植物园 1 文献情报中心 1