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高能物理研究所 891 近代物理研究所 595 上海药物研究所 427
地理科学与资源研究所 408 上海应用物理研究所 382 半导体研究所 377
化学研究所 361 合肥物质科学研究院 349 金属研究所 323
昆明植物研究所 283 地质与地球物理研究所 260 物理研究所 258
大连化学物理研究所 205 植物研究所 195 自动化研究所 173
宁波材料技术与工程研究所 171 广州地球化学研究所 170 长春应用化学研究所 163
中国科学院大学 142 上海硅酸盐研究所 134 西北高原生物研究所 129
南海海洋研究所 122 过程工程研究所 122 国家天文台 118
重庆绿色智能技术研究院 118 心理研究所 108 深圳先进技术研究院 106
广州能源研究所 97 长春光学精密机械与物理研究所 96 生态环境研究中心 94
动物研究所 91 海洋研究所 88 青岛生物能源与过程研究所 87
昆明动物研究所 81 遥感与数字地球研究所 78 兰州化学物理研究所 78
云南天文台 77 广州生物医药与健康研究院 76 上海光学精密机械研究所 73
西安光学精密机械研究所 73 计算技术研究所 68 地球环境研究所 65
成都山地灾害与环境研究所 64 南京地质古生物研究所 61 紫金山天文台 57
理论物理研究所 55 光电技术研究所 54 南京地理与湖泊研究所 54
武汉物理与数学研究所 54 上海生物化学与细胞生物学研究所 54 上海营养与健康研究所 54
数学与系统科学研究院 53 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 51 地球化学研究所 51
力学研究所 50 上海微系统与信息技术研究所 49 新疆理化技术研究所 48
武汉植物园 48 水生生物研究所 47 福建物质结构研究所 45
成都生物研究所 36 武汉岩土力学研究所 32 青藏高原研究所 31
国家空间科学中心 30 西双版纳热带植物园 29 工程热物理研究所 29
上海天文台 26 新疆天文台 25 生物物理研究所 22
寒区旱区环境与工程研究所 21 深海科学与工程研究所 21 烟台海岸带研究所 21
上海技术物理研究所 20 南京土壤研究所 19 软件研究所 19
青海盐湖研究所 17 沈阳自动化研究所 16 古脊椎动物与古人类研究所 16
沈阳应用生态研究所 15 天津工业生物技术研究所 14 武汉病毒研究所 13
微电子研究所 11 新疆生态与地理研究所 10 上海神经科学研究所 10
东北地理与农业生态研究所 8 亚热带农业生态研究所 7 山西煤炭化学研究所 6
上海有机化学研究所 6 水土保持研究所 6 科技战略咨询研究院 3
苏州生物医学工程技术研究所 2 国家授时中心 2 城市环境研究所 1
计算机网络信息中心 1 文献情报中心 1