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高能物理研究所 388 近代物理研究所 141 地质与地球物理研究所 134
上海药物研究所 120 化学研究所 102 昆明植物研究所 86
半导体研究所 81 西北高原生物研究所 80 生态环境研究中心 79
过程工程研究所 76 国家天文台 68 中国科学院大学 68
合肥物质科学研究院 64 金属研究所 56 植物研究所 46
地理科学与资源研究所 44 新疆天文台 44 成都山地灾害与环境研究所 43
云南天文台 43 物理研究所 42 宁波材料技术与工程研究所 42
紫金山天文台 42 大连化学物理研究所 41 计算技术研究所 38
动物研究所 38 水生生物研究所 37 自动化研究所 31
广州地球化学研究所 30 成都生物研究所 29 海洋研究所 28
沈阳应用生态研究所 24 烟台海岸带研究所 24 上海光学精密机械研究所 22
生物物理研究所 21 遥感与数字地球研究所 20 地球化学研究所 20
上海营养与健康研究所 20 西安光学精密机械研究所 18 理论物理研究所 17
光电技术研究所 17 寒区旱区环境与工程研究所 16 青岛生物能源与过程研究所 16
上海天文台 13 南京地质古生物研究所 13 心理研究所 13
重庆绿色智能技术研究院 13 地球环境研究所 13 武汉物理与数学研究所 12
武汉岩土力学研究所 12 软件研究所 12 南海海洋研究所 11
深圳先进技术研究院 11 武汉病毒研究所 11 武汉植物园 11
上海应用物理研究所 10 长春应用化学研究所 10 上海硅酸盐研究所 10
青藏高原研究所 9 南京地理与湖泊研究所 9 数学与系统科学研究院 8
上海生物化学与细胞生物学研究所 8 广州能源研究所 8 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 7
昆明动物研究所 7 国家授时中心 7 兰州化学物理研究所 6
力学研究所 5 国家空间科学中心 5 青海盐湖研究所 5
古脊椎动物与古人类研究所 5 广州生物医药与健康研究院 4 水土保持研究所 4
长春光学精密机械与物理研究所 3 西双版纳热带植物园 3 上海神经科学研究所 3
南京土壤研究所 3 新疆生态与地理研究所 2 科技战略咨询研究院 2
新疆理化技术研究所 2 声学研究所 2 深海科学与工程研究所 2
天津工业生物技术研究所 2 工程热物理研究所 2 亚热带农业生态研究所 1
兰州油气资源研究中心 1 上海微系统与信息技术研究所 1 计算机网络信息中心 1
上海技术物理研究所 1