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自动化研究所 175 合肥物质科学研究院 141 地理科学与资源研究所 138
昆明植物研究所 103 上海药物研究所 101 西北高原生物研究所 93
化学研究所 84 过程工程研究所 84 近代物理研究所 65
海洋研究所 64 中国科学院大学 55 植物研究所 55
生态环境研究中心 54 地质与地球物理研究所 48 半导体研究所 46
大连化学物理研究所 44 金属研究所 40 国家天文台 39
宁波材料技术与工程研究所 37 西安光学精密机械研究所 35 青藏高原研究所 34
南京地质古生物研究所 33 高能物理研究所 33 遥感与数字地球研究所 31
广州地球化学研究所 30 南京地理与湖泊研究所 30 成都山地灾害与环境研究所 29
计算技术研究所 29 重庆绿色智能技术研究院 29 广州能源研究所 29
水生生物研究所 26 心理研究所 26 武汉植物园 23
深圳先进技术研究院 21 理论物理研究所 21 西双版纳热带植物园 21
动物研究所 21 上海光学精密机械研究所 21 数学与系统科学研究院 19
上海硅酸盐研究所 19 深海科学与工程研究所 18 上海营养与健康研究所 17
工程热物理研究所 17 寒区旱区环境与工程研究所 16 长春应用化学研究所 16
紫金山天文台 16 青岛生物能源与过程研究所 15 力学研究所 13
武汉物理与数学研究所 13 地球化学研究所 13 烟台海岸带研究所 13
南海海洋研究所 12 软件研究所 12 古脊椎动物与古人类研究所 12
云南天文台 11 苏州生物医学工程技术研究所 10 新疆天文台 10
兰州化学物理研究所 10 沈阳应用生态研究所 8 地球环境研究所 8
文献情报中心 7 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 6 广州生物医药与健康研究院 6
武汉病毒研究所 6 武汉岩土力学研究所 6 生物物理研究所 5
长春光学精密机械与物理研究所 5 上海天文台 5 上海生物化学与细胞生物学研究所 5
天津工业生物技术研究所 5 国家空间科学中心 4 成都生物研究所 4
上海微系统与信息技术研究所 4 上海应用物理研究所 4 水土保持研究所 4
物理研究所 3 新疆生态与地理研究所 3 光电技术研究所 3
南京土壤研究所 3 昆明动物研究所 3 青海盐湖研究所 2
新疆理化技术研究所 2 南京天文光学技术研究所 2 沈阳自动化研究所 2
上海神经科学研究所 1 测量与地球物理研究所 1 东北地理与农业生态研究所 1
国家授时中心 1