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近代物理研究所 381 地理科学与资源研究所 289 上海应用物理研究所 252
高能物理研究所 219 西北高原生物研究所 177 合肥物质科学研究院 161
上海药物研究所 155 金属研究所 149 大连化学物理研究所 140
化学研究所 120 云南天文台 117 植物研究所 107
广州地球化学研究所 80 上海光学精密机械研究所 79 生态环境研究中心 77
地质与地球物理研究所 75 昆明植物研究所 75 中国科学院大学 73
长春光学精密机械与物理研究所 69 海洋研究所 67 国家天文台 64
半导体研究所 64 遥感与数字地球研究所 63 烟台海岸带研究所 62
过程工程研究所 57 宁波材料技术与工程研究所 56 武汉岩土力学研究所 56
物理研究所 49 西安光学精密机械研究所 46 深圳先进技术研究院 43
兰州化学物理研究所 43 上海营养与健康研究所 42 水生生物研究所 41
紫金山天文台 40 寒区旱区环境与工程研究所 39 上海天文台 38
自动化研究所 38 武汉植物园 37 水土保持研究所 36
心理研究所 35 上海硅酸盐研究所 34 动物研究所 33
长春应用化学研究所 32 武汉物理与数学研究所 24 重庆绿色智能技术研究院 23
力学研究所 22 南海海洋研究所 21 沈阳应用生态研究所 21
上海生物化学与细胞生物学研究所 20 成都山地灾害与环境研究所 18 计算技术研究所 17
国家空间科学中心 17 上海技术物理研究所 17 新疆天文台 16
广州能源研究所 16 西双版纳热带植物园 15 青岛生物能源与过程研究所 15
昆明动物研究所 15 沈阳自动化研究所 14 理论物理研究所 12
地球环境研究所 12 南京地质古生物研究所 11 武汉病毒研究所 11
国家授时中心 11 广州生物医药与健康研究院 10 上海微系统与信息技术研究所 10
深海科学与工程研究所 10 成都生物研究所 9 工程热物理研究所 9
青海盐湖研究所 8 南京地理与湖泊研究所 8 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 7
新疆生态与地理研究所 6 数学与系统科学研究院 6 光电技术研究所 6
地球化学研究所 6 古脊椎动物与古人类研究所 6 南京土壤研究所 5
苏州生物医学工程技术研究所 4 青藏高原研究所 3 科技战略咨询研究院 3
新疆理化技术研究所 3 亚热带农业生态研究所 2 微电子研究所 2
上海有机化学研究所 2 软件研究所 2 天津工业生物技术研究所 2
生物物理研究所 1 山西煤炭化学研究所 1 电子学研究所 1
上海神经科学研究所 1 测量与地球物理研究所 1 兰州油气资源研究中心 1
计算机网络信息中心 1 文献情报中心 1