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近代物理研究所 555 上海药物研究所 360 高能物理研究所 341
化学研究所 302 上海应用物理研究所 284 地质与地球物理研究所 253
合肥物质科学研究院 211 昆明植物研究所 191 大连化学物理研究所 187
广州地球化学研究所 158 金属研究所 153 海洋研究所 152
物理研究所 148 过程工程研究所 138 地球化学研究所 137
国家天文台 127 地理科学与资源研究所 121 中国科学院大学 118
植物研究所 118 半导体研究所 115 紫金山天文台 94
深圳先进技术研究院 93 西北高原生物研究所 93 武汉植物园 87
宁波材料技术与工程研究所 86 自动化研究所 69 水生生物研究所 68
生态环境研究中心 68 烟台海岸带研究所 65 动物研究所 64
上海硅酸盐研究所 61 广州生物医药与健康研究院 60 遥感与数字地球研究所 58
西安光学精密机械研究所 54 长春光学精密机械与物理研究所 51 青海盐湖研究所 51
南海海洋研究所 48 云南天文台 46 上海天文台 44
成都山地灾害与环境研究所 43 南京地质古生物研究所 43 武汉物理与数学研究所 42
心理研究所 40 上海光学精密机械研究所 39 长春应用化学研究所 38
山西煤炭化学研究所 36 青岛生物能源与过程研究所 36 理论物理研究所 34
光电技术研究所 34 力学研究所 31 重庆绿色智能技术研究院 31
上海营养与健康研究所 31 兰州化学物理研究所 30 数学与系统科学研究院 29
上海生物化学与细胞生物学研究所 29 沈阳应用生态研究所 28 寒区旱区环境与工程研究所 27
南京地理与湖泊研究所 26 新疆天文台 26 武汉病毒研究所 25
广州能源研究所 25 软件研究所 22 成都生物研究所 21
上海微系统与信息技术研究所 20 武汉岩土力学研究所 20 昆明动物研究所 20
西双版纳热带植物园 19 南京土壤研究所 18 青藏高原研究所 17
新疆生态与地理研究所 17 计算技术研究所 15 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 15
地球环境研究所 15 微电子研究所 11 深海科学与工程研究所 11
沈阳自动化研究所 11 工程热物理研究所 11 生物物理研究所 10
国家空间科学中心 9 新疆理化技术研究所 9 国家授时中心 7
上海神经科学研究所 6 上海技术物理研究所 6 亚热带农业生态研究所 4
福建物质结构研究所 4 天津工业生物技术研究所 4 古脊椎动物与古人类研究所 4
科技战略咨询研究院 3 东北地理与农业生态研究所 3 水土保持研究所 3
城市环境研究所 2 声学研究所 2 计算机网络信息中心 2
南京天文光学技术研究所 2 兰州油气资源研究中心 1 上海有机化学研究所 1
文献情报中心 1