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高能物理研究所 226 化学研究所 141 地理科学与资源研究所 140
大连化学物理研究所 136 近代物理研究所 121 自动化研究所 85
上海药物研究所 68 生态环境研究中心 68 长春光学精密机械与物理研究所 67
合肥物质科学研究院 67 深圳先进技术研究院 63 云南天文台 60
物理研究所 58 金属研究所 58 中国科学院大学 55
上海硅酸盐研究所 55 半导体研究所 52 动物研究所 47
兰州化学物理研究所 46 宁波材料技术与工程研究所 45 植物研究所 44
地质与地球物理研究所 43 过程工程研究所 42 昆明植物研究所 38
上海光学精密机械研究所 38 国家天文台 36 心理研究所 36
西安光学精密机械研究所 33 海洋研究所 32 成都山地灾害与环境研究所 28
烟台海岸带研究所 28 遥感与数字地球研究所 27 上海应用物理研究所 26
南京地质古生物研究所 25 数学与系统科学研究院 24 紫金山天文台 24
寒区旱区环境与工程研究所 21 武汉物理与数学研究所 21 广州地球化学研究所 20
上海天文台 20 力学研究所 18 地球化学研究所 18
成都生物研究所 17 西北高原生物研究所 17 长春应用化学研究所 17
水生生物研究所 16 重庆绿色智能技术研究院 16 国家授时中心 16
西双版纳热带植物园 15 沈阳自动化研究所 15 武汉植物园 14
武汉岩土力学研究所 14 计算技术研究所 12 软件研究所 12
上海营养与健康研究所 11 广州生物医药与健康研究院 10 新疆天文台 10
广州能源研究所 10 昆明动物研究所 9 南京地理与湖泊研究所 8
青岛生物能源与过程研究所 8 地球环境研究所 8 古脊椎动物与古人类研究所 8
国家空间科学中心 7 上海微系统与信息技术研究所 7 上海生物化学与细胞生物学研究所 7
生物物理研究所 6 南海海洋研究所 6 理论物理研究所 6
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 6 新疆生态与地理研究所 5 新疆理化技术研究所 5
上海有机化学研究所 5 青海盐湖研究所 4 沈阳应用生态研究所 4
山西煤炭化学研究所 3 城市环境研究所 3 武汉病毒研究所 3
东北地理与农业生态研究所 3 工程热物理研究所 3 福建物质结构研究所 2
科技战略咨询研究院 2 光电技术研究所 2 亚热带农业生态研究所 1
微电子研究所 1 南京土壤研究所 1 声学研究所 1
南京天文光学技术研究所 1 深海科学与工程研究所 1 水土保持研究所 1
上海技术物理研究所 1 天津工业生物技术研究所 1