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高能物理研究所 406 近代物理研究所 336 上海应用物理研究所 175
上海药物研究所 136 地理科学与资源研究所 123 化学研究所 113
昆明植物研究所 103 物理研究所 100 大连化学物理研究所 91
地质与地球物理研究所 72 半导体研究所 71 植物研究所 71
金属研究所 70 西北高原生物研究所 66 合肥物质科学研究院 66
生态环境研究中心 59 云南天文台 56 过程工程研究所 51
国家天文台 49 中国科学院大学 44 广州地球化学研究所 38
计算技术研究所 36 宁波材料技术与工程研究所 36 西安光学精密机械研究所 34
上海光学精密机械研究所 33 上海硅酸盐研究所 29 水生生物研究所 28
自动化研究所 28 动物研究所 28 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 27
武汉物理与数学研究所 27 沈阳自动化研究所 27 兰州化学物理研究所 27
上海营养与健康研究所 25 深圳先进技术研究院 24 长春光学精密机械与物理研究所 24
重庆绿色智能技术研究院 23 数学与系统科学研究院 22 地球化学研究所 21
地球环境研究所 21 成都山地灾害与环境研究所 20 广州生物医药与健康研究院 20
心理研究所 20 理论物理研究所 19 上海生物化学与细胞生物学研究所 19
南海海洋研究所 18 成都生物研究所 18 寒区旱区环境与工程研究所 18
沈阳应用生态研究所 17 昆明动物研究所 16 紫金山天文台 15
光电技术研究所 14 新疆天文台 14 深海科学与工程研究所 12
生物物理研究所 11 南京地理与湖泊研究所 11 力学研究所 10
西双版纳热带植物园 10 上海天文台 10 海洋研究所 9
长春应用化学研究所 9 青藏高原研究所 8 武汉岩土力学研究所 8
南京地质古生物研究所 7 青岛生物能源与过程研究所 7 国家空间科学中心 6
遥感与数字地球研究所 6 武汉病毒研究所 6 上海微系统与信息技术研究所 6
武汉植物园 6 广州能源研究所 6 古脊椎动物与古人类研究所 5
青海盐湖研究所 4 新疆理化技术研究所 4 山西煤炭化学研究所 3
亚热带农业生态研究所 3 上海神经科学研究所 3 烟台海岸带研究所 3
福建物质结构研究所 2 科技战略咨询研究院 2 微电子研究所 2
计算机网络信息中心 2 天津工业生物技术研究所 2 国家授时中心 2
南京土壤研究所 1 水土保持研究所 1 上海技术物理研究所 1
软件研究所 1 工程热物理研究所 1