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高能物理研究所 599 近代物理研究所 258 上海药物研究所 160
合肥物质科学研究院 125 上海应用物理研究所 117 物理研究所 114
大连化学物理研究所 107 云南天文台 83 金属研究所 79
昆明植物研究所 78 半导体研究所 77 化学研究所 76
地质与地球物理研究所 63 上海营养与健康研究所 63 自动化研究所 60
植物研究所 58 国家天文台 56 地理科学与资源研究所 54
中国科学院大学 49 生态环境研究中心 49 宁波材料技术与工程研究所 48
心理研究所 47 广州地球化学研究所 44 过程工程研究所 44
西安光学精密机械研究所 43 西北高原生物研究所 38 地球化学研究所 36
紫金山天文台 36 动物研究所 33 寒区旱区环境与工程研究所 29
兰州化学物理研究所 29 长春光学精密机械与物理研究所 28 深圳先进技术研究院 26
上海光学精密机械研究所 26 新疆天文台 25 数学与系统科学研究院 24
广州生物医药与健康研究院 24 海洋研究所 24 重庆绿色智能技术研究院 23
遥感与数字地球研究所 22 水生生物研究所 22 武汉植物园 22
上海硅酸盐研究所 22 上海微系统与信息技术研究所 21 烟台海岸带研究所 20
地球环境研究所 19 福建物质结构研究所 18 南京地质古生物研究所 17
青岛生物能源与过程研究所 17 南海海洋研究所 16 成都生物研究所 16
计算技术研究所 15 武汉岩土力学研究所 15 上海技术物理研究所 15
成都山地灾害与环境研究所 14 南京地理与湖泊研究所 14 上海生物化学与细胞生物学研究所 14
长春应用化学研究所 14 理论物理研究所 13 武汉物理与数学研究所 13
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 12 力学研究所 11 生物物理研究所 11
上海天文台 11 光电技术研究所 11 新疆理化技术研究所 10
武汉病毒研究所 10 西双版纳热带植物园 9 沈阳应用生态研究所 9
广州能源研究所 9 青藏高原研究所 7 新疆生态与地理研究所 7
上海神经科学研究所 7 水土保持研究所 6 软件研究所 6
天津工业生物技术研究所 6 国家空间科学中心 5 东北地理与农业生态研究所 5
深海科学与工程研究所 5 昆明动物研究所 5 古脊椎动物与古人类研究所 5
工程热物理研究所 5 青海盐湖研究所 4 南京土壤研究所 2
上海有机化学研究所 2 计算机网络信息中心 1 国家授时中心 1