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昆明植物研究所 175 海洋研究所 107 化学研究所 87
地理科学与资源研究所 86 生态环境研究中心 85 过程工程研究所 78
近代物理研究所 76 大连化学物理研究所 71 合肥物质科学研究院 70
上海药物研究所 61 地质与地球物理研究所 59 中国科学院大学 59
数学与系统科学研究院 55 广州地球化学研究所 54 植物研究所 49
半导体研究所 44 高能物理研究所 41 西北高原生物研究所 39
水生生物研究所 36 自动化研究所 36 动物研究所 36
成都山地灾害与环境研究所 32 金属研究所 31 遥感与数字地球研究所 29
国家天文台 29 上海营养与健康研究所 27 武汉物理与数学研究所 25
云南天文台 25 上海硅酸盐研究所 24 宁波材料技术与工程研究所 23
南京地质古生物研究所 20 深圳先进技术研究院 19 心理研究所 18
西安光学精密机械研究所 18 武汉岩土力学研究所 16 沈阳应用生态研究所 16
广州能源研究所 16 兰州化学物理研究所 16 计算技术研究所 15
西双版纳热带植物园 15 青岛生物能源与过程研究所 13 地球环境研究所 13
紫金山天文台 13 理论物理研究所 12 广州生物医药与健康研究院 12
重庆绿色智能技术研究院 12 南海海洋研究所 11 新疆天文台 11
南京地理与湖泊研究所 9 力学研究所 8 成都生物研究所 8
寒区旱区环境与工程研究所 8 地球化学研究所 8 深海科学与工程研究所 8
青藏高原研究所 7 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 7 武汉植物园 7
软件研究所 7 国家空间科学中心 6 新疆生态与地理研究所 6
上海天文台 6 上海光学精密机械研究所 6 工程热物理研究所 6
生物物理研究所 5 长春光学精密机械与物理研究所 5 青海盐湖研究所 5
南京土壤研究所 5 物理研究所 4 新疆理化技术研究所 4
武汉病毒研究所 4 上海应用物理研究所 4 沈阳自动化研究所 4
城市环境研究所 3 科技战略咨询研究院 3 光电技术研究所 3
长春应用化学研究所 3 烟台海岸带研究所 3 古脊椎动物与古人类研究所 3
山西煤炭化学研究所 2 上海神经科学研究所 2 测量与地球物理研究所 2
上海微系统与信息技术研究所 2 声学研究所 2 天津工业生物技术研究所 2
昆明动物研究所 2 自然科学史研究所 1 微电子研究所 1
上海生物化学与细胞生物学研究所 1 文献情报中心 1 国家授时中心 1