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西北高原生物研究所 266 上海药物研究所 214 昆明植物研究所 199
高能物理研究所 149 近代物理研究所 144 植物研究所 140
半导体研究所 111 化学研究所 109 大连化学物理研究所 100
地质与地球物理研究所 84 合肥物质科学研究院 84 地理科学与资源研究所 81
心理研究所 81 广州地球化学研究所 77 国家天文台 76
金属研究所 68 中国科学院大学 68 深圳先进技术研究院 53
地球化学研究所 52 过程工程研究所 50 动物研究所 45
海洋研究所 44 新疆天文台 43 西安光学精密机械研究所 43
宁波材料技术与工程研究所 42 生态环境研究中心 41 物理研究所 40
紫金山天文台 37 光电技术研究所 36 自动化研究所 36
水生生物研究所 35 上海硅酸盐研究所 29 古脊椎动物与古人类研究所 29
西双版纳热带植物园 28 新疆理化技术研究所 27 武汉岩土力学研究所 26
武汉物理与数学研究所 25 重庆绿色智能技术研究院 25 上海营养与健康研究所 25
烟台海岸带研究所 25 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 24 武汉植物园 24
寒区旱区环境与工程研究所 23 上海天文台 22 广州生物医药与健康研究院 22
沈阳应用生态研究所 22 天津工业生物技术研究所 21 地球环境研究所 19
兰州化学物理研究所 18 南海海洋研究所 17 青藏高原研究所 17
成都山地灾害与环境研究所 17 上海光学精密机械研究所 17 云南天文台 15
武汉病毒研究所 14 广州能源研究所 12 遥感与数字地球研究所 11
南京地理与湖泊研究所 11 南京地质古生物研究所 10 昆明动物研究所 9
力学研究所 8 生物物理研究所 8 计算技术研究所 8
数学与系统科学研究院 8 工程热物理研究所 8 新疆生态与地理研究所 7
理论物理研究所 6 国家授时中心 6 国家空间科学中心 5
上海应用物理研究所 5 青岛生物能源与过程研究所 5 上海生物化学与细胞生物学研究所 5
长春应用化学研究所 5 青海盐湖研究所 4 南京土壤研究所 4
上海微系统与信息技术研究所 4 深海科学与工程研究所 4 亚热带农业生态研究所 3
南京天文光学技术研究所 3 水土保持研究所 3 软件研究所 3
成都生物研究所 2 沈阳自动化研究所 2 上海技术物理研究所 2
科技战略咨询研究院 1 测量与地球物理研究所 1 兰州油气资源研究中心 1
声学研究所 1 计算机网络信息中心 1 文献情报中心 1