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近代物理研究所 805 高能物理研究所 780 长春光学精密机械与物理研究所 689
金属研究所 667 地理科学与资源研究所 359 寒区旱区环境与工程研究所 335
合肥物质科学研究院 248 国家天文台 137 半导体研究所 130
福建物质结构研究所 129 东北地理与农业生态研究所 87 云南天文台 86
紫金山天文台 82 西北高原生物研究所 74 新疆天文台 72
地质与地球物理研究所 60 国家空间科学中心 60 中国科学院大学 51
西安光学精密机械研究所 38 宁波材料技术与工程研究所 36 上海光学精密机械研究所 36
上海应用物理研究所 31 地球环境研究所 29 海洋研究所 25
动物研究所 25 过程工程研究所 22 水生生物研究所 20
广州地球化学研究所 18 新疆生态与地理研究所 18 化学研究所 16
理论物理研究所 15 大连化学物理研究所 15 上海药物研究所 14
昆明植物研究所 14 上海天文台 13 青岛生物能源与过程研究所 13
青藏高原研究所 12 亚热带农业生态研究所 12 心理研究所 12
沈阳应用生态研究所 12 深圳先进技术研究院 11 物理研究所 10
广州生物医药与健康研究院 10 南京土壤研究所 10 古脊椎动物与古人类研究所 10
遥感与数字地球研究所 9 武汉物理与数学研究所 9 自动化研究所 9
生态环境研究中心 9 烟台海岸带研究所 9 上海硅酸盐研究所 9
工程热物理研究所 9 武汉岩土力学研究所 7 武汉植物园 6
南海海洋研究所 5 成都山地灾害与环境研究所 5 水土保持研究所 5
植物研究所 5 力学研究所 4 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 4
南京地质古生物研究所 4 南京地理与湖泊研究所 4 上海技术物理研究所 4
成都生物研究所 3 上海神经科学研究所 3 国家授时中心 3
测量与地球物理研究所 2 光电技术研究所 2 重庆绿色智能技术研究院 2
广州能源研究所 2 兰州化学物理研究所 2 自然科学史研究所 1
数学与系统科学研究院 1 新疆理化技术研究所 1 武汉病毒研究所 1
上海微系统与信息技术研究所 1 地球化学研究所 1 上海生物化学与细胞生物学研究所 1
上海营养与健康研究所 1 深海科学与工程研究所 1