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高能物理研究所 482 上海药物研究所 248 近代物理研究所 230
地质与地球物理研究所 157 合肥物质科学研究院 157 化学研究所 148
国家天文台 136 金属研究所 124 昆明植物研究所 121
植物研究所 111 水生生物研究所 104 西北高原生物研究所 92
中国科学院大学 88 大连化学物理研究所 84 遥感与数字地球研究所 83
地理科学与资源研究所 82 福建物质结构研究所 65 广州地球化学研究所 63
重庆绿色智能技术研究院 63 上海应用物理研究所 58 心理研究所 56
自动化研究所 53 成都山地灾害与环境研究所 50 地球化学研究所 47
生态环境研究中心 47 过程工程研究所 41 动物研究所 40
半导体研究所 38 地球环境研究所 38 紫金山天文台 38
广州生物医药与健康研究院 37 深圳先进技术研究院 36 宁波材料技术与工程研究所 36
沈阳应用生态研究所 34 上海天文台 29 武汉植物园 27
西安光学精密机械研究所 27 理论物理研究所 26 青海盐湖研究所 26
海洋研究所 25 上海营养与健康研究所 25 武汉岩土力学研究所 25
长春应用化学研究所 25 力学研究所 24 数学与系统科学研究院 24
武汉物理与数学研究所 23 南海海洋研究所 22 西双版纳热带植物园 21
新疆天文台 20 广州能源研究所 20 上海硅酸盐研究所 20
工程热物理研究所 20 国家授时中心 19 南京地理与湖泊研究所 18
云南天文台 18 古脊椎动物与古人类研究所 16 计算技术研究所 15
昆明动物研究所 15 物理研究所 14 烟台海岸带研究所 14
上海生物化学与细胞生物学研究所 12 上海光学精密机械研究所 12 成都生物研究所 11
南京地质古生物研究所 11 武汉病毒研究所 11 光电技术研究所 11
生物物理研究所 10 深海科学与工程研究所 10 软件研究所 10
兰州化学物理研究所 10 青岛生物能源与过程研究所 9 长春光学精密机械与物理研究所 8
新疆理化技术研究所 7 南京土壤研究所 7 水土保持研究所 7
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 6 青藏高原研究所 5 新疆生态与地理研究所 5
寒区旱区环境与工程研究所 5 天津工业生物技术研究所 5 山西煤炭化学研究所 4
上海神经科学研究所 3 微电子研究所 3 沈阳自动化研究所 3
上海技术物理研究所 3 国家空间科学中心 2 上海有机化学研究所 2
亚热带农业生态研究所 1 电子学研究所 1 科技战略咨询研究院 1
测量与地球物理研究所 1