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高能物理研究所 474 上海药物研究所 272 近代物理研究所 271
昆明植物研究所 216 上海应用物理研究所 152 西北高原生物研究所 117
化学研究所 93 合肥物质科学研究院 93 广州能源研究所 93
地质与地球物理研究所 88 广州地球化学研究所 86 大连化学物理研究所 86
植物研究所 86 海洋研究所 76 心理研究所 69
生态环境研究中心 68 地理科学与资源研究所 67 国家天文台 67
过程工程研究所 67 中国科学院大学 61 金属研究所 54
动物研究所 49 成都山地灾害与环境研究所 46 半导体研究所 44
西安光学精密机械研究所 42 水生生物研究所 40 宁波材料技术与工程研究所 38
武汉物理与数学研究所 37 地球化学研究所 35 上海营养与健康研究所 32
遥感与数字地球研究所 30 紫金山天文台 30 数学与系统科学研究院 29
云南天文台 29 上海天文台 25 上海光学精密机械研究所 25
重庆绿色智能技术研究院 23 计算技术研究所 21 南京地质古生物研究所 21
广州生物医药与健康研究院 21 武汉植物园 20 成都生物研究所 19
深圳先进技术研究院 18 上海硅酸盐研究所 18 西双版纳热带植物园 17
自动化研究所 17 沈阳应用生态研究所 16 武汉病毒研究所 14
地球环境研究所 14 新疆天文台 13 烟台海岸带研究所 13
天津工业生物技术研究所 13 兰州化学物理研究所 13 南海海洋研究所 12
武汉岩土力学研究所 12 生物物理研究所 10 理论物理研究所 10
青岛生物能源与过程研究所 10 深海科学与工程研究所 9 工程热物理研究所 9
寒区旱区环境与工程研究所 8 南京地理与湖泊研究所 8 昆明动物研究所 8
力学研究所 7 物理研究所 7 新疆生态与地理研究所 7
上海神经科学研究所 7 新疆理化技术研究所 6 国家授时中心 6
光电技术研究所 5 上海生物化学与细胞生物学研究所 5 古脊椎动物与古人类研究所 5
青藏高原研究所 3 国家空间科学中心 3 亚热带农业生态研究所 3
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 3 长春光学精密机械与物理研究所 2 城市环境研究所 2
电子学研究所 2 计算机网络信息中心 2 软件研究所 2
自然科学史研究所 1 青海盐湖研究所 1 东北地理与农业生态研究所 1
南京土壤研究所 1 南京天文光学技术研究所 1 水土保持研究所 1
沈阳自动化研究所 1 长春应用化学研究所 1 文献情报中心 1