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高能物理研究所 273 近代物理研究所 255 大连化学物理研究所 206
上海药物研究所 136 昆明植物研究所 128 半导体研究所 121
地质与地球物理研究所 109 地理科学与资源研究所 104 自动化研究所 102
金属研究所 100 合肥物质科学研究院 90 西北高原生物研究所 85
国家天文台 85 植物研究所 80 上海应用物理研究所 77
化学研究所 76 地球化学研究所 75 生态环境研究中心 67
物理研究所 62 中国科学院大学 60 广州地球化学研究所 59
宁波材料技术与工程研究所 51 海洋研究所 49 广州生物医药与健康研究院 48
水生生物研究所 44 遥感与数字地球研究所 42 云南天文台 41
西安光学精密机械研究所 41 动物研究所 40 武汉物理与数学研究所 38
紫金山天文台 38 上海光学精密机械研究所 37 广州能源研究所 36
武汉岩土力学研究所 35 沈阳自动化研究所 34 深圳先进技术研究院 32
南京地质古生物研究所 27 成都山地灾害与环境研究所 26 烟台海岸带研究所 25
上海天文台 23 心理研究所 23 上海营养与健康研究所 20
昆明动物研究所 20 沈阳应用生态研究所 18 南海海洋研究所 17
重庆绿色智能技术研究院 17 兰州化学物理研究所 17 计算技术研究所 16
过程工程研究所 16 南京土壤研究所 14 青藏高原研究所 13
理论物理研究所 13 新疆天文台 13 青岛生物能源与过程研究所 12
地球环境研究所 12 上海硅酸盐研究所 12 西双版纳热带植物园 11
力学研究所 9 光电技术研究所 9 寒区旱区环境与工程研究所 8
武汉植物园 8 天津工业生物技术研究所 8 数学与系统科学研究院 7
青海盐湖研究所 7 新疆生态与地理研究所 6 长春光学精密机械与物理研究所 6
武汉病毒研究所 6 国家空间科学中心 5 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 5
科技战略咨询研究院 5 生物物理研究所 4 成都生物研究所 4
南京地理与湖泊研究所 4 东北地理与农业生态研究所 4 上海生物化学与细胞生物学研究所 4
深海科学与工程研究所 4 水土保持研究所 4 长春应用化学研究所 4
古脊椎动物与古人类研究所 4 国家授时中心 4 工程热物理研究所 4
软件研究所 3 上海神经科学研究所 2 新疆理化技术研究所 2
上海有机化学研究所 2 南京天文光学技术研究所 2 亚热带农业生态研究所 1
计算机网络信息中心 1 文献情报中心 1