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近代物理研究所 101 昆明植物研究所 100 化学研究所 97
地理科学与资源研究所 73 上海药物研究所 70 地质与地球物理研究所 68
自动化研究所 55 西北高原生物研究所 54 海洋研究所 54
植物研究所 54 广州地球化学研究所 53 合肥物质科学研究院 50
中国科学院大学 49 心理研究所 47 生态环境研究中心 47
大连化学物理研究所 38 西安光学精密机械研究所 38 宁波材料技术与工程研究所 36
国家天文台 35 成都山地灾害与环境研究所 33 过程工程研究所 32
金属研究所 31 光电技术研究所 31 深圳先进技术研究院 29
高能物理研究所 29 上海营养与健康研究所 25 动物研究所 24
重庆绿色智能技术研究院 24 青藏高原研究所 23 西双版纳热带植物园 20
地球化学研究所 18 半导体研究所 18 新疆理化技术研究所 17
南京地质古生物研究所 16 紫金山天文台 16 武汉物理与数学研究所 15
遥感与数字地球研究所 14 南京地理与湖泊研究所 13 上海生物化学与细胞生物学研究所 13
南海海洋研究所 12 理论物理研究所 12 新疆生态与地理研究所 12
云南天文台 12 兰州化学物理研究所 12 水生生物研究所 11
软件研究所 11 武汉岩土力学研究所 10 地球环境研究所 10
上海光学精密机械研究所 10 上海硅酸盐研究所 10 武汉植物园 9
新疆天文台 9 计算技术研究所 8 数学与系统科学研究院 8
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 7 青海盐湖研究所 7 沈阳应用生态研究所 7
烟台海岸带研究所 7 成都生物研究所 6 青岛生物能源与过程研究所 6
生物物理研究所 5 国家空间科学中心 5 南京土壤研究所 5
上海技术物理研究所 5 工程热物理研究所 5 广州生物医药与健康研究院 4
声学研究所 4 计算机网络信息中心 4 深海科学与工程研究所 4
广州能源研究所 4 昆明动物研究所 4 古脊椎动物与古人类研究所 4
上海应用物理研究所 3 长春应用化学研究所 3 力学研究所 2
上海天文台 2 科技战略咨询研究院 2 武汉病毒研究所 2
上海有机化学研究所 2 文献情报中心 2 天津工业生物技术研究所 2
物理研究所 1 长春光学精密机械与物理研究所 1 长春人造卫星观测站 1
测量与地球物理研究所 1 寒区旱区环境与工程研究所 1 上海微系统与信息技术研究所 1
水土保持研究所 1 国家授时中心 1