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高能物理研究所 449 近代物理研究所 245 上海药物研究所 169
地理科学与资源研究所 160 化学研究所 158 大连化学物理研究所 118
物理研究所 116 过程工程研究所 114 国家天文台 104
金属研究所 101 昆明植物研究所 101 合肥物质科学研究院 97
植物研究所 93 心理研究所 88 云南天文台 85
中国科学院大学 74 半导体研究所 74 重庆绿色智能技术研究院 73
地质与地球物理研究所 70 自动化研究所 70 宁波材料技术与工程研究所 67
西安光学精密机械研究所 67 生态环境研究中心 54 成都山地灾害与环境研究所 52
兰州化学物理研究所 52 长春光学精密机械与物理研究所 50 上海营养与健康研究所 46
新疆天文台 41 紫金山天文台 41 动物研究所 38
深圳先进技术研究院 37 海洋研究所 37 武汉物理与数学研究所 36
上海应用物理研究所 36 生物物理研究所 33 地球环境研究所 33
上海光学精密机械研究所 33 广州能源研究所 32 上海硅酸盐研究所 31
上海天文台 29 广州地球化学研究所 28 西北高原生物研究所 27
新疆理化技术研究所 27 计算技术研究所 24 寒区旱区环境与工程研究所 24
遥感与数字地球研究所 23 国家授时中心 23 沈阳应用生态研究所 22
南海海洋研究所 21 广州生物医药与健康研究院 21 水生生物研究所 21
武汉植物园 21 烟台海岸带研究所 21 西双版纳热带植物园 20
数学与系统科学研究院 19 地球化学研究所 19 天津工业生物技术研究所 18
理论物理研究所 17 上海生物化学与细胞生物学研究所 17 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 16
南京地质古生物研究所 14 青岛生物能源与过程研究所 14 长春应用化学研究所 13
昆明动物研究所 13 力学研究所 12 南京地理与湖泊研究所 12
武汉岩土力学研究所 12 古脊椎动物与古人类研究所 12 新疆生态与地理研究所 11
青海盐湖研究所 11 工程热物理研究所 11 国家空间科学中心 10
武汉病毒研究所 10 深海科学与工程研究所 9 青藏高原研究所 8
光电技术研究所 8 南京土壤研究所 8 成都生物研究所 7
东北地理与农业生态研究所 7 上海神经科学研究所 6 沈阳自动化研究所 5
上海技术物理研究所 5 上海微系统与信息技术研究所 4 微电子研究所 3
上海有机化学研究所 2 计算机网络信息中心 2 福建物质结构研究所 1
城市环境研究所 1 科技战略咨询研究院 1 测量与地球物理研究所 1
声学研究所 1 南京天文光学技术研究所 1 软件研究所 1