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昆明植物研究所 357 高能物理研究所 225 近代物理研究所 223
化学研究所 206 自动化研究所 178 上海药物研究所 137
地理科学与资源研究所 135 大连化学物理研究所 129 过程工程研究所 97
宁波材料技术与工程研究所 90 西北高原生物研究所 87 合肥物质科学研究院 83
半导体研究所 78 金属研究所 72 中国科学院大学 71
动物研究所 69 植物研究所 59 国家天文台 55
云南天文台 53 上海硅酸盐研究所 53 上海应用物理研究所 52
物理研究所 50 地质与地球物理研究所 50 广州地球化学研究所 50
西安光学精密机械研究所 49 寒区旱区环境与工程研究所 45 成都山地灾害与环境研究所 44
心理研究所 42 海洋研究所 40 上海营养与健康研究所 33
生态环境研究中心 32 水生生物研究所 31 地球化学研究所 31
光电技术研究所 30 重庆绿色智能技术研究院 30 长春应用化学研究所 30
上海光学精密机械研究所 28 地球环境研究所 26 遥感与数字地球研究所 25
深圳先进技术研究院 23 武汉植物园 23 兰州化学物理研究所 23
计算技术研究所 22 南京地质古生物研究所 22 理论物理研究所 20
青海盐湖研究所 20 新疆天文台 19 紫金山天文台 19
南海海洋研究所 18 长春光学精密机械与物理研究所 18 数学与系统科学研究院 16
南京地理与湖泊研究所 16 武汉物理与数学研究所 16 烟台海岸带研究所 16
昆明动物研究所 16 新疆生态与地理研究所 14 生物物理研究所 13
新疆理化技术研究所 13 上海天文台 12 沈阳应用生态研究所 12
软件研究所 12 成都生物研究所 11 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 10
青岛生物能源与过程研究所 10 西双版纳热带植物园 9 武汉病毒研究所 9
力学研究所 8 广州生物医药与健康研究院 8 国家授时中心 8
古脊椎动物与古人类研究所 7 南京土壤研究所 6 广州能源研究所 6
国家空间科学中心 5 上海生物化学与细胞生物学研究所 5 水土保持研究所 4
工程热物理研究所 4 武汉岩土力学研究所 3 沈阳自动化研究所 3
天津工业生物技术研究所 3 青藏高原研究所 2 科技战略咨询研究院 2
上海神经科学研究所 2 长春人造卫星观测站 1 城市环境研究所 1
上海有机化学研究所 1 上海微系统与信息技术研究所 1 声学研究所 1
计算机网络信息中心 1 上海技术物理研究所 1 文献情报中心 1