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高能物理研究所 695 上海药物研究所 447 近代物理研究所 443
地质与地球物理研究所 346 化学研究所 335 地理科学与资源研究所 297
昆明植物研究所 294 西北高原生物研究所 266 半导体研究所 261
合肥物质科学研究院 261 大连化学物理研究所 247 长春应用化学研究所 228
上海应用物理研究所 225 金属研究所 218 生态环境研究中心 162
植物研究所 153 广州地球化学研究所 149 物理研究所 145
宁波材料技术与工程研究所 145 过程工程研究所 142 水生生物研究所 135
海洋研究所 129 中国科学院大学 125 自动化研究所 122
南海海洋研究所 118 动物研究所 96 心理研究所 94
国家天文台 92 地球化学研究所 91 云南天文台 83
深圳先进技术研究院 80 紫金山天文台 77 武汉物理与数学研究所 75
西安光学精密机械研究所 70 重庆绿色智能技术研究院 69 上海硅酸盐研究所 68
广州生物医药与健康研究院 61 上海微系统与信息技术研究所 60 长春光学精密机械与物理研究所 58
上海光学精密机械研究所 54 成都山地灾害与环境研究所 50 计算技术研究所 49
青藏高原研究所 48 福建物质结构研究所 48 遥感与数字地球研究所 47
武汉植物园 44 南京地质古生物研究所 43 上海营养与健康研究所 42
理论物理研究所 37 成都生物研究所 36 昆明动物研究所 36
西双版纳热带植物园 35 烟台海岸带研究所 35 兰州化学物理研究所 35
新疆理化技术研究所 33 上海生物化学与细胞生物学研究所 33 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 32
新疆天文台 31 广州能源研究所 31 光电技术研究所 30
南京土壤研究所 30 地球环境研究所 30 上海天文台 28
南京地理与湖泊研究所 28 国家空间科学中心 22 青岛生物能源与过程研究所 22
寒区旱区环境与工程研究所 21 武汉病毒研究所 21 武汉岩土力学研究所 20
沈阳应用生态研究所 20 力学研究所 19 数学与系统科学研究院 19
生物物理研究所 18 深海科学与工程研究所 17 青海盐湖研究所 16
工程热物理研究所 16 古脊椎动物与古人类研究所 15 新疆生态与地理研究所 14
上海技术物理研究所 13 水土保持研究所 12 软件研究所 11
沈阳自动化研究所 10 天津工业生物技术研究所 10 声学研究所 8
亚热带农业生态研究所 7 微电子研究所 5 上海神经科学研究所 4
计算机网络信息中心 4 文献情报中心 3 东北地理与农业生态研究所 2
上海有机化学研究所 2 国家授时中心 2 苏州生物医学工程技术研究所 1
山西煤炭化学研究所 1 长春人造卫星观测站 1