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高能物理研究所 359 昆明植物研究所 208 近代物理研究所 184
化学研究所 150 地理科学与资源研究所 138 上海药物研究所 131
合肥物质科学研究院 124 植物研究所 124 地质与地球物理研究所 120
半导体研究所 119 金属研究所 109 物理研究所 106
寒区旱区环境与工程研究所 93 大连化学物理研究所 81 自动化研究所 81
广州生物医药与健康研究院 63 青藏高原研究所 61 长春应用化学研究所 59
西北高原生物研究所 56 兰州化学物理研究所 56 生态环境研究中心 54
南海海洋研究所 52 深圳先进技术研究院 48 中国科学院大学 48
南京地理与湖泊研究所 41 海洋研究所 41 过程工程研究所 38
地球化学研究所 38 上海应用物理研究所 37 成都山地灾害与环境研究所 36
云南天文台 36 广州地球化学研究所 33 宁波材料技术与工程研究所 33
烟台海岸带研究所 31 重庆绿色智能技术研究院 30 数学与系统科学研究院 29
心理研究所 27 动物研究所 27 西安光学精密机械研究所 26
遥感与数字地球研究所 25 上海硅酸盐研究所 25 昆明动物研究所 25
国家天文台 24 国家授时中心 23 长春光学精密机械与物理研究所 22
沈阳自动化研究所 22 南京地质古生物研究所 21 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 18
理论物理研究所 17 武汉岩土力学研究所 17 武汉物理与数学研究所 16
地球环境研究所 16 紫金山天文台 16 上海光学精密机械研究所 15
力学研究所 14 新疆生态与地理研究所 14 水生生物研究所 14
上海生物化学与细胞生物学研究所 14 生物物理研究所 13 西双版纳热带植物园 12
青海盐湖研究所 12 武汉植物园 12 上海营养与健康研究所 11
古脊椎动物与古人类研究所 11 计算技术研究所 10 光电技术研究所 9
上海天文台 8 武汉病毒研究所 8 广州能源研究所 8
成都生物研究所 7 青岛生物能源与过程研究所 7 软件研究所 7
上海微系统与信息技术研究所 6 新疆天文台 6 深海科学与工程研究所 6
沈阳应用生态研究所 6 国家空间科学中心 5 天津工业生物技术研究所 5
新疆理化技术研究所 4 东北地理与农业生态研究所 4 南京土壤研究所 4
水土保持研究所 4 山西煤炭化学研究所 3 微电子研究所 3
福建物质结构研究所 2 上海神经科学研究所 2 计算机网络信息中心 2
工程热物理研究所 2 南京天文光学技术研究所 1