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海洋研究所 343 近代物理研究所 316 高能物理研究所 314
化学研究所 245 地理科学与资源研究所 233 合肥物质科学研究院 173
上海药物研究所 160 大连化学物理研究所 125 植物研究所 124
昆明植物研究所 123 西北高原生物研究所 110 中国科学院大学 110
长春光学精密机械与物理研究所 100 半导体研究所 91 云南天文台 86
地球环境研究所 86 自动化研究所 78 上海应用物理研究所 77
广州地球化学研究所 75 地球化学研究所 74 地质与地球物理研究所 73
宁波材料技术与工程研究所 73 国家天文台 72 金属研究所 69
重庆绿色智能技术研究院 66 烟台海岸带研究所 63 西双版纳热带植物园 62
生态环境研究中心 55 水生生物研究所 52 光电技术研究所 51
物理研究所 50 西安光学精密机械研究所 49 过程工程研究所 47
长春应用化学研究所 44 上海微系统与信息技术研究所 43 沈阳自动化研究所 43
深圳先进技术研究院 38 上海硅酸盐研究所 38 动物研究所 37
广州能源研究所 36 沈阳应用生态研究所 35 心理研究所 34
新疆天文台 33 成都山地灾害与环境研究所 32 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 32
上海光学精密机械研究所 32 紫金山天文台 30 广州生物医药与健康研究院 29
计算技术研究所 28 理论物理研究所 28 武汉物理与数学研究所 26
上海营养与健康研究所 24 武汉岩土力学研究所 23 南海海洋研究所 22
兰州化学物理研究所 20 力学研究所 19 南京地理与湖泊研究所 19
青岛生物能源与过程研究所 17 天津工业生物技术研究所 17 上海天文台 15
青海盐湖研究所 15 数学与系统科学研究院 13 国家授时中心 13
东北地理与农业生态研究所 12 上海生物化学与细胞生物学研究所 11 武汉植物园 9
深海科学与工程研究所 9 南京地质古生物研究所 8 遥感与数字地球研究所 8
昆明动物研究所 8 生物物理研究所 7 工程热物理研究所 7
上海神经科学研究所 6 软件研究所 6 古脊椎动物与古人类研究所 6
青藏高原研究所 5 新疆生态与地理研究所 5 福建物质结构研究所 5
成都生物研究所 5 科技战略咨询研究院 5 寒区旱区环境与工程研究所 5
新疆理化技术研究所 5 武汉病毒研究所 5 微电子研究所 4
南京土壤研究所 4 计算机网络信息中心 4 国家空间科学中心 3
城市环境研究所 2 水土保持研究所 2 山西煤炭化学研究所 1
亚热带农业生态研究所 1 文献情报中心 1