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近代物理研究所 404 高能物理研究所 402 昆明植物研究所 223
上海药物研究所 158 西北高原生物研究所 138 上海应用物理研究所 110
地理科学与资源研究所 105 化学研究所 98 大连化学物理研究所 95
植物研究所 94 合肥物质科学研究院 91 广州能源研究所 85
金属研究所 69 地质与地球物理研究所 69 国家天文台 69
中国科学院大学 64 广州地球化学研究所 61 生态环境研究中心 56
海洋研究所 55 深圳先进技术研究院 53 云南天文台 53
上海营养与健康研究所 48 过程工程研究所 46 心理研究所 44
动物研究所 44 半导体研究所 44 水生生物研究所 41
物理研究所 37 南海海洋研究所 35 西安光学精密机械研究所 34
紫金山天文台 34 新疆天文台 29 宁波材料技术与工程研究所 27
重庆绿色智能技术研究院 26 沈阳应用生态研究所 26 广州生物医药与健康研究院 25
计算技术研究所 24 自动化研究所 24 上海天文台 22
地球化学研究所 22 成都山地灾害与环境研究所 20 南京地质古生物研究所 20
西双版纳热带植物园 18 成都生物研究所 18 理论物理研究所 17
新疆理化技术研究所 16 上海硅酸盐研究所 15 昆明动物研究所 15
南京土壤研究所 14 武汉物理与数学研究所 14 武汉植物园 13
遥感与数字地球研究所 12 南京地理与湖泊研究所 11 烟台海岸带研究所 11
寒区旱区环境与工程研究所 10 光电技术研究所 10 青岛生物能源与过程研究所 10
武汉病毒研究所 9 武汉岩土力学研究所 9 深海科学与工程研究所 9
上海光学精密机械研究所 9 古脊椎动物与古人类研究所 9 长春光学精密机械与物理研究所 8
上海生物化学与细胞生物学研究所 8 地球环境研究所 8 兰州化学物理研究所 8
新疆生态与地理研究所 7 青海盐湖研究所 7 国家授时中心 7
力学研究所 6 数学与系统科学研究院 6 国家空间科学中心 5
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 5 上海微系统与信息技术研究所 5 沈阳自动化研究所 4
长春应用化学研究所 4 青藏高原研究所 3 生物物理研究所 2
亚热带农业生态研究所 2 城市环境研究所 2 天津工业生物技术研究所 2
长春人造卫星观测站 1 科技战略咨询研究院 1 上海神经科学研究所 1
上海有机化学研究所 1 计算机网络信息中心 1 南京天文光学技术研究所 1
水土保持研究所 1 软件研究所 1 工程热物理研究所 1