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高能物理研究所 725 上海药物研究所 600 过程工程研究所 598
近代物理研究所 416 大连化学物理研究所 368 西北高原生物研究所 356
化学研究所 344 地理科学与资源研究所 322 海洋研究所 295
合肥物质科学研究院 281 金属研究所 275 地质与地球物理研究所 244
昆明植物研究所 241 自动化研究所 217 上海应用物理研究所 201
植物研究所 186 中国科学院大学 182 国家天文台 175
心理研究所 174 广州地球化学研究所 167 生态环境研究中心 154
水生生物研究所 139 南京地质古生物研究所 131 西安光学精密机械研究所 125
半导体研究所 124 深圳先进技术研究院 116 上海光学精密机械研究所 116
动物研究所 113 云南天文台 110 紫金山天文台 105
广州能源研究所 98 宁波材料技术与工程研究所 97 成都山地灾害与环境研究所 96
武汉物理与数学研究所 91 上海硅酸盐研究所 91 上海营养与健康研究所 83
计算技术研究所 80 遥感与数字地球研究所 69 烟台海岸带研究所 68
物理研究所 65 上海天文台 65 西双版纳热带植物园 64
理论物理研究所 59 武汉植物园 57 广州生物医药与健康研究院 53
地球化学研究所 52 成都生物研究所 51 武汉病毒研究所 49
新疆天文台 48 地球环境研究所 47 兰州化学物理研究所 46
重庆绿色智能技术研究院 44 光电技术研究所 43 数学与系统科学研究院 42
寒区旱区环境与工程研究所 42 青岛生物能源与过程研究所 40 南京地理与湖泊研究所 38
沈阳应用生态研究所 32 南海海洋研究所 30 长春光学精密机械与物理研究所 29
天津工业生物技术研究所 29 青藏高原研究所 28 生物物理研究所 27
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 26 武汉岩土力学研究所 25 软件研究所 25
青海盐湖研究所 23 深海科学与工程研究所 22 昆明动物研究所 22
古脊椎动物与古人类研究所 22 工程热物理研究所 22 新疆生态与地理研究所 20
长春应用化学研究所 20 力学研究所 19 上海微系统与信息技术研究所 18
新疆理化技术研究所 15 国家空间科学中心 14 上海生物化学与细胞生物学研究所 14
沈阳自动化研究所 14 水土保持研究所 13 南京土壤研究所 12
南京天文光学技术研究所 9 国家授时中心 9 科技战略咨询研究院 7
上海神经科学研究所 7 计算机网络信息中心 7 山西煤炭化学研究所 6
微电子研究所 5 文献情报中心 5 苏州生物医学工程技术研究所 3
亚热带农业生态研究所 3 兰州油气资源研究中心 3 东北地理与农业生态研究所 2
上海有机化学研究所 2 自然科学史研究所 1 上海技术物理研究所 1