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高能物理研究所 339 地理科学与资源研究所 275 西北高原生物研究所 216
合肥物质科学研究院 204 地质与地球物理研究所 191 遥感与数字地球研究所 175
过程工程研究所 174 金属研究所 149 近代物理研究所 146
化学研究所 145 上海药物研究所 129 海洋研究所 128
国家天文台 119 生态环境研究中心 112 大连化学物理研究所 102
植物研究所 102 自动化研究所 99 广州地球化学研究所 93
昆明植物研究所 77 中国科学院大学 77 深圳先进技术研究院 74
宁波材料技术与工程研究所 64 广州能源研究所 64 动物研究所 57
西安光学精密机械研究所 57 半导体研究所 56 心理研究所 55
上海硅酸盐研究所 51 计算技术研究所 49 武汉物理与数学研究所 47
地球化学研究所 46 武汉岩土力学研究所 44 广州生物医药与健康研究院 43
青岛生物能源与过程研究所 41 上海营养与健康研究所 40 工程热物理研究所 38
重庆绿色智能技术研究院 36 兰州化学物理研究所 35 成都山地灾害与环境研究所 34
上海应用物理研究所 34 水生生物研究所 33 沈阳应用生态研究所 32
上海光学精密机械研究所 32 云南天文台 31 光电技术研究所 29
南京地理与湖泊研究所 29 紫金山天文台 29 上海天文台 27
青海盐湖研究所 26 数学与系统科学研究院 25 南京地质古生物研究所 25
理论物理研究所 24 地球环境研究所 24 寒区旱区环境与工程研究所 21
水土保持研究所 20 武汉植物园 19 长春应用化学研究所 19
新疆天文台 18 长春光学精密机械与物理研究所 17 物理研究所 16
软件研究所 16 国家空间科学中心 15 古脊椎动物与古人类研究所 15
武汉病毒研究所 14 烟台海岸带研究所 14 力学研究所 13
新疆生态与地理研究所 12 青藏高原研究所 11 国家授时中心 11
南海海洋研究所 10 西双版纳热带植物园 10 生物物理研究所 9
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 9 新疆理化技术研究所 8 上海微系统与信息技术研究所 8
沈阳自动化研究所 8 南京土壤研究所 5 南京天文光学技术研究所 5
上海生物化学与细胞生物学研究所 5 深海科学与工程研究所 5 电子学研究所 3
成都生物研究所 3 上海技术物理研究所 3 天津工业生物技术研究所 3
昆明动物研究所 3 山西煤炭化学研究所 2 科技战略咨询研究院 2
微电子研究所 2 福建物质结构研究所 1 测量与地球物理研究所 1
声学研究所 1 计算机网络信息中心 1 文献情报中心 1