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大连化学物理研究所 615 高能物理研究所 486 地理科学与资源研究所 469
西北高原生物研究所 446 上海药物研究所 425 合肥物质科学研究院 425
化学研究所 290 昆明植物研究所 282 金属研究所 259
宁波材料技术与工程研究所 241 过程工程研究所 240 近代物理研究所 234
地质与地球物理研究所 227 海洋研究所 209 生态环境研究中心 185
自动化研究所 139 中国科学院大学 137 植物研究所 126
西安光学精密机械研究所 123 半导体研究所 116 上海硅酸盐研究所 112
广州地球化学研究所 104 遥感与数字地球研究所 101 国家天文台 96
深圳先进技术研究院 94 水生生物研究所 91 动物研究所 86
上海营养与健康研究所 83 国家授时中心 81 物理研究所 80
心理研究所 76 长春光学精密机械与物理研究所 73 地球化学研究所 71
武汉植物园 67 地球环境研究所 66 上海光学精密机械研究所 65
成都山地灾害与环境研究所 61 新疆天文台 57 生物物理研究所 54
数学与系统科学研究院 54 计算技术研究所 53 南京地理与湖泊研究所 51
南京地质古生物研究所 50 紫金山天文台 47 古脊椎动物与古人类研究所 45
云南天文台 42 沈阳应用生态研究所 42 理论物理研究所 41
青岛生物能源与过程研究所 41 西双版纳热带植物园 39 青藏高原研究所 38
广州能源研究所 38 烟台海岸带研究所 38 寒区旱区环境与工程研究所 34
软件研究所 34 兰州化学物理研究所 34 南海海洋研究所 33
上海天文台 33 工程热物理研究所 32 光电技术研究所 29
长春应用化学研究所 29 广州生物医药与健康研究院 27 新疆理化技术研究所 26
上海应用物理研究所 26 重庆绿色智能技术研究院 26 新疆生态与地理研究所 22
武汉物理与数学研究所 22 武汉岩土力学研究所 22 上海生物化学与细胞生物学研究所 21
国家空间科学中心 20 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 20 武汉病毒研究所 20
力学研究所 18 青海盐湖研究所 18 天津工业生物技术研究所 18
成都生物研究所 17 深海科学与工程研究所 16 南京土壤研究所 14
昆明动物研究所 14 山西煤炭化学研究所 13 沈阳自动化研究所 12
上海微系统与信息技术研究所 9 上海有机化学研究所 7 苏州生物医学工程技术研究所 5
兰州油气资源研究中心 5 东北地理与农业生态研究所 5 电子学研究所 4
科技战略咨询研究院 4 微电子研究所 3 上海技术物理研究所 3
上海神经科学研究所 2 水土保持研究所 2 自然科学史研究所 1
亚热带农业生态研究所 1 测量与地球物理研究所 1 声学研究所 1
计算机网络信息中心 1 南京天文光学技术研究所 1 文献情报中心 1