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自动化研究所 550 地理科学与资源研究所 476 合肥物质科学研究院 376
近代物理研究所 347 高能物理研究所 302 地质与地球物理研究所 291
植物研究所 271 金属研究所 269 化学研究所 212
西北高原生物研究所 210 上海药物研究所 205 上海应用物理研究所 201
海洋研究所 183 广州地球化学研究所 180 大连化学物理研究所 173
物理研究所 165 宁波材料技术与工程研究所 148 过程工程研究所 147
长春光学精密机械与物理研究所 137 生态环境研究中心 136 半导体研究所 132
烟台海岸带研究所 128 昆明植物研究所 122 中国科学院大学 119
国家天文台 112 地球环境研究所 111 南海海洋研究所 100
西安光学精密机械研究所 97 心理研究所 95 长春应用化学研究所 92
遥感与数字地球研究所 86 动物研究所 75 深圳先进技术研究院 73
计算技术研究所 71 上海光学精密机械研究所 67 地球化学研究所 65
云南天文台 65 理论物理研究所 62 兰州化学物理研究所 62
上海硅酸盐研究所 59 沈阳自动化研究所 56 寒区旱区环境与工程研究所 55
重庆绿色智能技术研究院 52 南京地质古生物研究所 51 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 50
数学与系统科学研究院 47 成都山地灾害与环境研究所 44 昆明动物研究所 41
新疆生态与地理研究所 37 上海微系统与信息技术研究所 35 武汉植物园 35
深海科学与工程研究所 35 武汉物理与数学研究所 34 水生生物研究所 33
青岛生物能源与过程研究所 32 紫金山天文台 29 力学研究所 28
广州生物医药与健康研究院 28 成都生物研究所 27 西双版纳热带植物园 25
上海营养与健康研究所 25 广州能源研究所 24 青藏高原研究所 23
沈阳应用生态研究所 23 新疆理化技术研究所 22 上海生物化学与细胞生物学研究所 20
软件研究所 20 上海神经科学研究所 18 南京地理与湖泊研究所 17
东北地理与农业生态研究所 17 工程热物理研究所 17 生物物理研究所 15
光电技术研究所 15 武汉岩土力学研究所 15 国家空间科学中心 14
南京土壤研究所 14 武汉病毒研究所 13 水土保持研究所 12
上海天文台 11 新疆天文台 11 天津工业生物技术研究所 7
国家授时中心 7 文献情报中心 6 山西煤炭化学研究所 5
福建物质结构研究所 5 科技战略咨询研究院 5 南京天文光学技术研究所 5
古脊椎动物与古人类研究所 4 苏州生物医学工程技术研究所 3 亚热带农业生态研究所 3
青海盐湖研究所 3 微电子研究所 3 自然科学史研究所 1
城市环境研究所 1 上海有机化学研究所 1 计算机网络信息中心 1