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高能物理研究所 661 西北高原生物研究所 445 近代物理研究所 385
上海应用物理研究所 233 合肥物质科学研究院 201 昆明植物研究所 199
半导体研究所 186 上海药物研究所 182 化学研究所 181
地质与地球物理研究所 148 金属研究所 141 物理研究所 126
大连化学物理研究所 115 植物研究所 114 中国科学院大学 106
地理科学与资源研究所 105 生态环境研究中心 100 寒区旱区环境与工程研究所 98
上海硅酸盐研究所 87 西安光学精密机械研究所 86 海洋研究所 78
宁波材料技术与工程研究所 75 过程工程研究所 75 云南天文台 69
动物研究所 66 心理研究所 64 国家天文台 61
广州地球化学研究所 60 长春光学精密机械与物理研究所 60 长春应用化学研究所 59
自动化研究所 53 水生生物研究所 51 紫金山天文台 46
深圳先进技术研究院 45 上海光学精密机械研究所 43 成都山地灾害与环境研究所 41
南海海洋研究所 38 南京地质古生物研究所 35 上海营养与健康研究所 35
数学与系统科学研究院 34 南京地理与湖泊研究所 33 沈阳应用生态研究所 32
广州能源研究所 32 遥感与数字地球研究所 31 地球环境研究所 31
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 30 重庆绿色智能技术研究院 30 计算技术研究所 28
地球化学研究所 26 上海生物化学与细胞生物学研究所 26 广州生物医药与健康研究院 24
烟台海岸带研究所 24 武汉物理与数学研究所 23 古脊椎动物与古人类研究所 23
理论物理研究所 22 武汉植物园 22 青藏高原研究所 19
南京土壤研究所 19 力学研究所 18 新疆天文台 18
成都生物研究所 17 上海微系统与信息技术研究所 17 上海天文台 16
新疆理化技术研究所 16 深海科学与工程研究所 16 沈阳自动化研究所 16
生物物理研究所 15 武汉病毒研究所 15 青岛生物能源与过程研究所 15
福建物质结构研究所 14 青海盐湖研究所 14 西双版纳热带植物园 13
昆明动物研究所 13 水土保持研究所 12 武汉岩土力学研究所 11
国家空间科学中心 10 工程热物理研究所 10 新疆生态与地理研究所 9
光电技术研究所 7 兰州化学物理研究所 7 天津工业生物技术研究所 6
亚热带农业生态研究所 4 东北地理与农业生态研究所 4 上海神经科学研究所 3
计算机网络信息中心 3 文献情报中心 3 软件研究所 3
国家授时中心 3 城市环境研究所 2 微电子研究所 2
上海有机化学研究所 2 上海技术物理研究所 2 自然科学史研究所 1
长春人造卫星观测站 1 科技战略咨询研究院 1 兰州油气资源研究中心 1