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高能物理研究所 379 近代物理研究所 304 上海药物研究所 170
化学研究所 142 物理研究所 135 地理科学与资源研究所 132
上海应用物理研究所 131 西北高原生物研究所 103 昆明植物研究所 92
合肥物质科学研究院 92 大连化学物理研究所 85 长春应用化学研究所 85
国家天文台 79 中国科学院大学 64 植物研究所 61
地质与地球物理研究所 59 金属研究所 58 半导体研究所 55
过程工程研究所 45 西安光学精密机械研究所 45 深圳先进技术研究院 44
心理研究所 44 海洋研究所 44 古脊椎动物与古人类研究所 44
云南天文台 43 宁波材料技术与工程研究所 38 自动化研究所 37
生态环境研究中心 36 长春光学精密机械与物理研究所 32 烟台海岸带研究所 32
上海硅酸盐研究所 31 寒区旱区环境与工程研究所 28 动物研究所 28
遥感与数字地球研究所 24 广州地球化学研究所 23 新疆理化技术研究所 23
上海营养与健康研究所 23 上海光学精密机械研究所 22 理论物理研究所 21
沈阳应用生态研究所 20 兰州化学物理研究所 20 紫金山天文台 18
上海天文台 16 广州生物医药与健康研究院 16 计算技术研究所 15
数学与系统科学研究院 15 青岛生物能源与过程研究所 15 上海生物化学与细胞生物学研究所 15
成都山地灾害与环境研究所 14 青海盐湖研究所 14 新疆生态与地理研究所 12
地球化学研究所 12 上海微系统与信息技术研究所 11 新疆天文台 11
力学研究所 10 微电子研究所 10 武汉物理与数学研究所 10
地球环境研究所 10 武汉植物园 9 重庆绿色智能技术研究院 9
深海科学与工程研究所 9 南京地理与湖泊研究所 8 沈阳自动化研究所 8
南海海洋研究所 7 南京地质古生物研究所 7 水生生物研究所 7
上海神经科学研究所 6 武汉岩土力学研究所 6 天津工业生物技术研究所 6
昆明动物研究所 6 生物物理研究所 5 苏州纳米技术与纳米仿生研究所 5
水土保持研究所 5 国家授时中心 5 山西煤炭化学研究所 4
光电技术研究所 4 南京土壤研究所 4 青藏高原研究所 3
国家空间科学中心 3 福建物质结构研究所 3 西双版纳热带植物园 3
武汉病毒研究所 3 东北地理与农业生态研究所 3 广州能源研究所 3
上海技术物理研究所 2 工程热物理研究所 2 苏州生物医学工程技术研究所 1
亚热带农业生态研究所 1 成都生物研究所 1 上海有机化学研究所 1
计算机网络信息中心 1 南京天文光学技术研究所 1 文献情报中心 1
软件研究所 1