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高能物理研究所 424	长春光学精密机械与物理研究所 339	金属研究所 276
近代物理研究所 212	地理科学与资源研究所 187	福建物质结构研究所 159
国家天文台 102	紫金山天文台 80	寒区旱区环境与工程研究所 69
云南天文台 61	上海天文台 48	合肥物质科学研究院 37
过程工程研究所 36	地质与地球物理研究所 34	半导体研究所 33
生态环境研究中心 33	地球环境研究所 27	化学研究所 24
中国科学院大学 22	上海光学精密机械研究所 22	植物研究所 22
心理研究所 21	新疆天文台 21	上海硅酸盐研究所 21
广州地球化学研究所 18	东北地理与农业生态研究所 17	西安光学精密机械研究所 17
深圳先进技术研究院 16	宁波材料技术与工程研究所 16	上海药物研究所 15
自动化研究所 14	国家空间科学中心 13	昆明植物研究所 13
海洋研究所 12	武汉植物园 12	西北高原生物研究所 11
上海营养与健康研究所 11	动物研究所 10	大连化学物理研究所 9
水生生物研究所 9	遥感与数字地球研究所 8	新疆生态与地理研究所 7
武汉病毒研究所 7	青岛生物能源与过程研究所 7	地球化学研究所 7
工程热物理研究所 7	苏州纳米技术与纳米仿生研究所 6	水土保持研究所 6
天津工业生物技术研究所 6	国家授时中心 6	南海海洋研究所 5
山西煤炭化学研究所 5	武汉物理与数学研究所 5	广州能源研究所 5
物理研究所 4	青藏高原研究所 4	成都山地灾害与环境研究所 4
南京地质古生物研究所 4	广州生物医药与健康研究院 4	武汉岩土力学研究所 4
理论物理研究所 3	西双版纳热带植物园 3	数学与系统科学研究院 3
南京地理与湖泊研究所 3	南京土壤研究所 3	重庆绿色智能技术研究院 3
沈阳应用生态研究所 3	上海技术物理研究所 3	烟台海岸带研究所 3
古脊椎动物与古人类研究所 3	计算技术研究所 2	深海科学与工程研究所 2
软件研究所 2	兰州化学物理研究所 2	成都生物研究所 1
上海神经科学研究所 1	测量与地球物理研究所 1	上海微系统与信息技术研究所 1
上海应用物理研究所 1	计算机网络信息中心 1	沈阳自动化研究所 1