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近代物理研究所 377 高能物理研究所 282 地理科学与资源研究所 210
上海药物研究所 193 化学研究所 110 合肥物质科学研究院 109
大连化学物理研究所 98 地质与地球物理研究所 80 深圳先进技术研究院 74
植物研究所 72 西北高原生物研究所 67 金属研究所 66
昆明植物研究所 65 半导体研究所 58 中国科学院大学 56
武汉物理与数学研究所 49 上海光学精密机械研究所 49 水生生物研究所 48
国家天文台 47 兰州化学物理研究所 47 宁波材料技术与工程研究所 43
西安光学精密机械研究所 43 心理研究所 42 动物研究所 40
南京地理与湖泊研究所 37 海洋研究所 37 过程工程研究所 36
自动化研究所 35 生态环境研究中心 35 紫金山天文台 32
成都山地灾害与环境研究所 31 广州地球化学研究所 31 上海应用物理研究所 31
新疆天文台 31 遥感与数字地球研究所 28 武汉岩土力学研究所 28
武汉植物园 27 上海硅酸盐研究所 27 新疆生态与地理研究所 25
新疆理化技术研究所 25 广州能源研究所 24 广州生物医药与健康研究院 22
南海海洋研究所 20 重庆绿色智能技术研究院 20 青藏高原研究所 18
上海营养与健康研究所 18 水土保持研究所 17 地球环境研究所 17
理论物理研究所 16 上海生物化学与细胞生物学研究所 16 生物物理研究所 15
上海天文台 14 云南天文台 14 成都生物研究所 13
物理研究所 12 沈阳应用生态研究所 12 长春应用化学研究所 12
计算技术研究所 11 国家空间科学中心 11 光电技术研究所 11
长春光学精密机械与物理研究所 10 青岛生物能源与过程研究所 10 地球化学研究所 10
南京地质古生物研究所 9 青海盐湖研究所 9 昆明动物研究所 9
西双版纳热带植物园 8 寒区旱区环境与工程研究所 8 武汉病毒研究所 8
工程热物理研究所 8 深海科学与工程研究所 7 烟台海岸带研究所 7
力学研究所 6 数学与系统科学研究院 5 国家授时中心 5
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 4 沈阳自动化研究所 4 软件研究所 4
计算机网络信息中心 3 亚热带农业生态研究所 2 南京天文光学技术研究所 2
古脊椎动物与古人类研究所 2 苏州生物医学工程技术研究所 1 福建物质结构研究所 1
科技战略咨询研究院 1 上海神经科学研究所 1 微电子研究所 1
南京土壤研究所 1 上海技术物理研究所 1 天津工业生物技术研究所 1