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自动化研究所 462 过程工程研究所 357 地理科学与资源研究所 229
生态环境研究中心 200 长春应用化学研究所 157 遥感与数字地球研究所 140
大连化学物理研究所 128 烟台海岸带研究所 107 计算技术研究所 98
西安光学精密机械研究所 77 兰州化学物理研究所 77 上海应用物理研究所 70
西北高原生物研究所 69 沈阳自动化研究所 66 长春光学精密机械与物理研究所 50
沈阳应用生态研究所 47 金属研究所 44 合肥物质科学研究院 44
高能物理研究所 40 地质与地球物理研究所 39 化学研究所 37
海洋研究所 37 宁波材料技术与工程研究所 36 中国科学院大学 36
软件研究所 32 新疆理化技术研究所 31 近代物理研究所 26
青海盐湖研究所 25 新疆生态与地理研究所 23 广州能源研究所 22
上海药物研究所 21 武汉岩土力学研究所 21 水生生物研究所 19
昆明植物研究所 19 地球化学研究所 19 物理研究所 16
数学与系统科学研究院 16 南海海洋研究所 15 成都生物研究所 15
理论物理研究所 14 光电技术研究所 14 力学研究所 13
成都山地灾害与环境研究所 12 半导体研究所 12 国家天文台 11
南京土壤研究所 11 青岛生物能源与过程研究所 11 地球环境研究所 11
寒区旱区环境与工程研究所 10 文献情报中心 10 心理研究所 8
植物研究所 8 西双版纳热带植物园 7 重庆绿色智能技术研究院 7
青藏高原研究所 6 福建物质结构研究所 6 上海微系统与信息技术研究所 6
武汉物理与数学研究所 6 武汉植物园 6 上海营养与健康研究所 6
苏州纳米技术与纳米仿生研究所 4 上海硅酸盐研究所 4 深海科学与工程研究所 3
昆明动物研究所 3 古脊椎动物与古人类研究所 3 国家空间科学中心 2
科技战略咨询研究院 2 上海生物化学与细胞生物学研究所 2 水土保持研究所 2
计算机网络信息中心 1 南京天文光学技术研究所 1 新疆天文台 1
云南天文台 1 上海技术物理研究所 1 上海光学精密机械研究所 1
华南植物园 1 国家授时中心 1 紫金山天文台 1