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地理科学与资源研究所 346 理论物理研究所 311 高能物理研究所 265
生态环境研究中心 262 上海天文台 158 近代物理研究所 143
国家天文台 142 上海应用物理研究所 113 上海微系统与信息技术研究所 107
紫金山天文台 105 烟台海岸带研究所 73 海洋研究所 62
自动化研究所 56 地质与地球物理研究所 54 沈阳应用生态研究所 54
青藏高原研究所 53 心理研究所 39 成都山地灾害与环境研究所 34
云南天文台 34 地球化学研究所 32 植物研究所 32
水生生物研究所 31 地球环境研究所 31 物理研究所 27
中国科学院大学 26 南海海洋研究所 24 遥感与数字地球研究所 24
重庆绿色智能技术研究院 24 金属研究所 22 新疆天文台 22
过程工程研究所 21 南京土壤研究所 21 西双版纳热带植物园 20
水土保持研究所 19 新疆生态与地理研究所 17 武汉植物园 16
寒区旱区环境与工程研究所 15 成都生物研究所 13 合肥物质科学研究院 13
昆明植物研究所 12 武汉物理与数学研究所 12 力学研究所 10
国家空间科学中心 10 兰州油气资源研究中心 9 上海光学精密机械研究所 9
长春光学精密机械与物理研究所 7 西北高原生物研究所 7 深海科学与工程研究所 7
长春应用化学研究所 7 兰州化学物理研究所 7 宁波材料技术与工程研究所 6
武汉岩土力学研究所 6 昆明动物研究所 6 数学与系统科学研究院 5
大连化学物理研究所 5 广州能源研究所 5 化学研究所 4
青海盐湖研究所 4 福建物质结构研究所 3 南京地质古生物研究所 3
南京地理与湖泊研究所 3 半导体研究所 3 西安光学精密机械研究所 3
上海神经科学研究所 2 上海药物研究所 2 东北地理与农业生态研究所 2
上海营养与健康研究所 2 软件研究所 2 工程热物理研究所 2
新疆理化技术研究所 1 青岛生物能源与过程研究所 1 沈阳自动化研究所 1
古脊椎动物与古人类研究所 1