机构

• 海洋研究所 [2]
• 生态环境研究中心 [2]

采集方式

• OAI收割 [4]

内容类型

• 专利 [2]
• 学位论文 [2]

发表日期

• 2012 [2]
• 2008 [2]

学科主题

• 环境科学::环境化学 [1]

筛选

浏览/检索结果: 共4条，第1-4条 帮助 条数/页： 5101520253035404550556065707580859095100 排序方式： 请选择题名升序题名降序提交时间升序提交时间降序作者升序作者降序发表日期升序发表日期降序 一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利  OAI收割 专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10 作者:  刘保忠 收藏  |  浏览/下载：30/0  |  提交时间：2014/08/04 一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法  2)引物设计：在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物  GC含量为40％?60％  退火温度为45?65℃  预期PCR产物长度为100?400bp  3)引物优化：根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化  4)微卫星标记家系鉴定体系的确立：微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量  包括微卫星位点来源  引物设计条件为：引物长度为19?25mer  在Tm值上下各10℃  根据上述优化获得的Ta值  引物设计  温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测  选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息  引物优化和微卫星标记家系鉴定体系  选取杂带较少  根据PIC值  其特征在于：1)微卫星位点的来源：提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA  特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta  PIC小于0.25的标记  采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段  筛选得到重复性好  并构建微卫星磁珠富集文库  稳定性好  检测阳性克隆  PIC值大于0.25的位点  经测序得到含有微卫星重复的DNA序列  作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系  用于文蛤的家系区分与个体识别。   土壤古菌的多尺度分布特征及其生态学机制 学位论文  OAI收割 博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2012 曹鹏 收藏  |  浏览/下载：91/0  |  提交时间：2013/12/19 土壤古菌  土壤细菌  群落组成和分布特征  多尺度  生态位理论  中性理论  空间因子  环境因子  物种多度拟合模型  荧光实时定量PCR  末端限制性片段多态性  克隆和测序  soil archaea  soil bacteria  community composition and distribution  multiple scale  niche theory  neutraltheory  spatial factors  environmental factors  species abundance fitting models  real-time PCR  terminal restriction fragment length polymorphism  cloning and sequencing   土壤细菌群落多样性变化的驱动因子及生态效应 学位论文  OAI收割 博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2008 葛源 收藏  |  浏览/下载：189/0  |  提交时间：2010/05/28 土壤微生物  生物多样性  结构和功能  生态系统功能  变性梯度凝 胶电泳（DGGE）  末端限制性片段长度多态性（T-RFLP）  克隆和测序  多 元回归树（MRT）分析  聚合推进树（ABT）分析 Soil microorganisms  Biodiversity  Structure and function  Ecosystem function  Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)  Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP)  Cloning and sequencing  Multivariate regression tree (MRT)  Aggregated boosted tree (ABT)   栉孔扇贝G-型溶菌酶基因多态性标记筛选及其辅助育种方法 专利  OAI收割 专利类型: 发明, 专利号: CN200810015048.4, 申请日期: 2008-09-03, 公开日期: 2008-09-03 宋林生; 李凌; 赵建民 收藏  |  浏览/下载：32/0  |  提交时间：2014/08/04 1  2)抗病群体和敏感群体的制备  3)抗病相关G-型溶菌酶基因标记的筛选  4)携带抗病相关基因标记个体的快速筛查。1)栉孔扇贝G-型溶菌酶基因启动区部分序列的克隆：参照分子克隆所述方法从栉孔扇贝闭壳肌中提取总DNA  根据已知的G-型溶菌酶基因序列在其启动子区设计引物  即从不同海区和养殖场收集栉孔扇贝个体  PCR扩增42个敏感个体和40个抗病个体的G-型溶菌酶启动区序列后  其中-754ID和-754II个体在抗病群体和敏感群体中出现的频率无显著差别  一种栉孔扇贝抗病相关G-型溶菌酶基因标记  克隆得到一段762个碱基的DNA序列  用病原菌浸泡感染  针对-754TATCTCGATCAGG插入/缺失(I/D)及-391A/G转换分别选用Taq I和Hap II对PCR产物进行酶切  而-391AA个体在敏感群体中出现的频率显著高于抗病群体  其特征在于它的技术内容包括以下四个方面：1)栉孔扇贝G-型溶菌酶基因启动区部分序列的克隆  连入T载体后进行测序  根据死亡时间判断扇贝对病原菌感染抵抗能力  聚丙烯酰胺凝胶电泳后  -391AG个体在抗病群体中出现的频率显著高于敏感群体。因此  获得其核苷酸序列。2)抗病群体和敏感群体的制备：采用人工感染的方法获得抗病群体和敏感群体  将扇贝分为抗病群体和敏感群体。3)抗病相关G-型溶菌酶基因标记的筛选：对来自5个个体的10个克隆进行了测序  各发现两种基因型  将-391AA作为疾病敏感相关的G-型溶菌酶基因标记  发现了10处多态性位点  -754II  而将-391AG作为抗病相关的G-型溶菌酶基因标记。4)携带抗病相关基因标记个体的快速筛查：取栉孔扇贝个体全血1μl作为模版  -754ID  PCR扩增G-型溶菌酶基因启动区序列  -391AA和-391AG  用Hap II对产物进行酶切  聚丙烯酰胺凝胶电泳分型后  选择-391AG个体作为抗病个体。