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学科主题
生态学 [1]
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基于全基因组选择的长牡蛎肥满度分布参数预测方法
CNKI期刊论文
OAI收割
2020
作者:
董青原
;
曹隽喆
;
张国范
;
李莉
;
刘圣
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提交时间:2024/12/18
全基因组选择
单核苷酸多态性
二次特征选择
高斯通用加性模型
长牡蛎
基于高密度 SNP 芯片的绵羊肉用性状全基因组关联分析
学位论文
OAI收割
新疆乌鲁木齐: 中国科学院大学, 2017
作者:
张志峰
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浏览/下载:315/0
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提交时间:2018/01/12
全基因组关联分析
绵羊
肉用性状
单核苷酸多态性
高密度 Snp芯片
中国近海小黄鱼SNP标记开发及种群基因组学研究
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院大学, 2016
作者:
张柏东
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提交时间:2016/06/01
小黄鱼
单核苷酸多态性标记
RAD-seq
群体遗传结构
本地适应性
种群基因组学
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
基于二代测序技术的非人灵长类的基因组和转录组的比较研究
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2012
作者:
张雁峰
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提交时间:2012/08/01
非人灵长类
基因组
转录组
二代测序
单核苷酸多态性
凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组测序初步分析及培养条件的探讨
学位论文
OAI收割
硕士, 北京: 中国科学院研究生院, 2011
严雪平
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提交时间:2012/06/25
肠道微生物
宏基因组
16S rDNA
RFLP(限制性片段长度多态性)
Solexa 测序
藏鸡和姬鼠属(Apodemus )系统进化中的比较基因组学研究
学位论文
OAI收割
硕士, 北京: 中国科学院研究生院, 2006
作者:
童晓梅
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浏览/下载:38/0
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提交时间:2010/10/14
SNP(单核苷酸多态性)
姬鼠属
系统进化树
遗传标记
线粒体基因组
藏鸡
基因结构
空间搭载水稻种子后代基因组多态性及其与空间重离子辐射关系的探讨
期刊论文
OAI收割
生物物理学报, 2006, 卷号: 2006, 期号: 02, 页码: 131-138
骆艺
;
王旭杰
;
梅曼彤
;
庄楚雄
;
周峰
;
卫增泉
;
颉红梅
;
姚涓
;
赵均良
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浏览/下载:25/0
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提交时间:2010/10/29
水稻种子
基因组多态性
空间搭载
重离子辐射
东方田鼠长江亚种和指名亚种基因组DNA序列比较分析
会议论文
OAI收割
2002
许冰
;
胡维新
;
杨榕
;
王勇
;
刘新发
;
彭兴华
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浏览/下载:33/0
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提交时间:2012/05/29
序列比较分析:6583
东方田鼠:5410
指名亚种:4103
基因组DNA:3150
长江:523
生物信息学方法:345
抗日本血吸虫:329
DNA序列分析:215
多态性位点:211
进化规律:188
6个虾种基因组DNA多态性分析
CNKI期刊论文
OAI收割
2001
作者:
许玉德,孙晟
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提交时间:2024/12/20
虾类
基因组DNA
随机扩增多态性DNA