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生物科学::植物学 [1]
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基于转录组的深海海参系统发育关系 及深海热液指参的适应性演化研究
学位论文
OAI收割
中国科学院深海科学与工程研究所: 中国科学院大学, 2023
作者:
蒲玉瑾
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提交时间:2023/10/24
海参
DNA 提取
转录组
系统发育关系
染色体基因组
噬菌体基因组DNA快速提取方法
期刊论文
OAI收割
热带生物学报, 2017, 卷号: 8, 期号: 02, 页码: 232-235
作者:
刘秋婷
;
田雨顺
;
云龙
;
罗鹏
;
胡超群
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浏览/下载:123/0
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提交时间:2018/09/07
噬菌体基因组DNA
快速提取方法
核酸降解
噬菌体粒子沉淀
白草种子基因组DNA五种提取方法的比较
中文期刊论文
OAI收割
2016
作者:
郝豆豆
;
田志华
;
雷鸣
;
武俊喜
;
拉多
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浏览/下载:40/0
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提交时间:2016/12/27
白草
基因组DNA
DNA提取方法
高盐低pH法
白草种子基因组DNA五种提取方法的比较
中文期刊论文
OAI收割
2016
作者:
郝豆豆
;
田志华
;
雷鸣
;
武俊喜
;
拉多
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浏览/下载:129/0
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提交时间:2017/11/07
白草
基因组DNA
DNA提取方法
高盐低pH法
一种改良的植物基因组DNA通用提取方法
期刊论文
OAI收割
植物分类与资源学报, 2014, 期号: 3, 页码: 375-380
陈林杨
;
宋敏舒
;
查红光
;
李志敏
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浏览/下载:30/0
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提交时间:2015/01/20
植物基因组DNA
通用DNA提取方法
植物材料
海洋底泥环境DNA提取与纯化方法比较研究
期刊论文
OAI收割
大连理工大学学报, 2014, 期号: 03, 页码: 272-277
王晓辉
;
黄李淑馨
;
白凤武
;
杜昱光
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浏览/下载:32/0
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提交时间:2014/08/27
宏基因组DNA
提取
纯化
海洋底泥
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:33/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
一种海蜇基因组DNA的提取方法-1
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201010166122.X, 申请日期: 2011-03-23, 公开日期: 2011-03-23
崔朝霞
;
张姝
;
栾维莎
;
刘媛
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浏览/下载:31/0
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提交时间:2014/08/04
一种海蜇基因组DNA提取方法
2)将保存的蝶状体样品放入离心管中并直接加入buffer300~400ul匀浆
3)将步骤2)中消化后的溶液取出加入6M?NaCl
其特征在于:1)将海蜇有性世代的海蜇碟状体置入体积浓度为95%的酒精中脱水并保存
30~40ul质量浓度为10%的SDS
振荡浑匀20~30S
3~5ul浓度为20mg/ml的蛋白酶K
10000~12000rpm离心20?30分钟
封口后55~56℃消化0.8~1.0小时
吸上清
待用
而后加入上清液的0.7~1倍体积的异丙醇
?20~?18℃沉淀10~15分钟
沉淀后取出
以10000~12000rpm离心15?20分钟
弃去液体
并用体积浓度为70%的乙醇
离心洗1~2次
自然室温凉干
即得到海蜇碟状体的DNA。
一种海蜇基因组DNA的提取方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200710015295.X, 申请日期: 2009-01-14, 公开日期: 2009-01-14
崔朝霞
;
张姝
;
栾维莎
;
刘媛
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浏览/下载:86/0
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提交时间:2014/08/04
1.一种海蛰基因组DNA提取方法
2)将步骤1)得到的原料内加入3~5ul浓度为20mg/ml的蛋白酶K
3)在步骤2)澄清溶液中加入与其等体积的苯酚
而后向上清液中加入上清液的0.7~1倍体积的异丙醇
其中苯酚
其特征在于:1)将海蜇无性世代的海蛰螅状体用手术剪刀剪碎至无明显颗粒状组织
在55~56℃消化24~26小时至溶液澄清
氯仿和异戊醇的混合溶液混匀
-20~-18℃沉淀10~15分钟
氯仿和异戊醇按体积份数比为25∶24∶1
加入CTAB buffer300~400ul
待用
离心
沉淀后取出
氯仿和异戊醇按体积份数比为24∶1。
待用
吸上清
离心
再加入与上清液等体积的氯仿和异戊醇混合液混匀
弃去液体
离心
并用体积浓度为70%的乙醇
吸上清
离心洗1~2次
将多余液体倒去室温自然凉干
即得到海蛰螅状体的基因组DNA
一种高效提取虎耳草科植物基因组DNA的方法
期刊论文
OAI收割
安徽农业科学, 2008, 卷号: 36, 期号: 16, 页码: 6673-6674,6728
作者:
陈世龙
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提交时间:2009/11/07
虎耳草科
基因组DNA 提取
psbA-trnH