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沈阳应用生态研究所 [6]
水生生物研究所 [1]
海洋研究所 [1]
生态环境研究中心 [1]
采集方式
OAI收割 [9]
内容类型
学位论文 [5]
期刊论文 [3]
专利 [1]
发表日期
2012 [1]
2007 [1]
2006 [1]
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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:32/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
土壤宏基因组学技术及其应用
期刊论文
OAI收割
应用生态学报, 2007, 卷号: 1, 期号: 1, 页码: 212-218
沈菊培
;
张丽梅
;
郑袁明
;
朱永官
;
贺纪正
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提交时间:2015/04/24
宏基因组学
土壤DNA提取
文库构建
文库筛选
应用
白鱀豚基因组DNA文库构建及应用——兼论哺乳动物C值变异和进化的关系
学位论文
OAI收割
博士, 水生生物研究所: 中国科学院水生生物研究所, 2006
杜波
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浏览/下载:345/56
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提交时间:2010/11/16
白鱀豚
基因组文库
细菌人工染色体
α乳白蛋白基因
图位克隆
基因组大小
C值
非编码DNA
进化复杂度
生物多样性
2-KGA蛭孤菌J26基因组DNA文库的构建
期刊论文
OAI收割
云南大学学报(自然科学版), 1999, 期号: S3, 页码: 10-13
作者:
焦鹏,胡江春,马成新,薛德林,王书锦
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浏览/下载:9/0
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提交时间:2011/05/05
2-kga蛭弧菌
基因组dna文库
2-KGA蛭孤菌J26基因组DNA文库的构建
期刊论文
OAI收割
云南大学学报(自然科学版), 1999, 期号: S3, 页码: 10-13
焦鹏,胡江春,马成新,薛德林,王书锦
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浏览/下载:12/0
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提交时间:2011/05/05
2-KGA蛭弧菌
基因组DNA文库
中国辽宁海洋放线菌资源、生物学特性及一株新种的鉴定命名
学位论文
OAI收割
中国科学院沈阳应用生态研究所: 中国科学院沈阳应用生态研究所, 1998
作者:
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浏览/下载:20/0
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提交时间:2010/12/15
海洋放线菌
资源考察
索孢天蓝链霉菌
大豆连作障碍
基因组dna文库
中国辽宁海洋放线菌资源、生物学特性及一株新种的鉴定命名
学位论文
OAI收割
博士, 中国科学院沈阳应用生态研究所: 中国科学院沈阳应用生态研究所, 1998
谢秋宏
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浏览/下载:197/30
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提交时间:2010/12/15
海洋放线菌
资源考察
索孢天蓝链霉菌
大豆连作障碍
基因组DNA文库
Vc2980基因操作系统及筛选模型建立和kgr基因克隆
学位论文
OAI收割
中国科学院沈阳应用生态研究所: 中国科学院沈阳应用生态研究所, 1997
作者:
赵巍
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浏览/下载:8/0
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提交时间:2010/12/15
维生素c生产用菌系2980
筛选模型
G. Oxydans基因组dna文库
Kgr克隆
Vc2980基因操作系统及筛选模型建立和kgr基因克隆
学位论文
OAI收割
博士, 中国科学院沈阳应用生态研究所: 中国科学院沈阳应用生态研究所, 1997
赵巍
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浏览/下载:48/0
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提交时间:2010/12/15
维生素C生产用菌系2980
筛选模型
G. oxydans基因组DNA文库
kgr克隆