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异型花多态性微卫星标记的开发(英文)
期刊论文
OAI收割
生命科学研究, 2023, 卷号: 27, 期号: 01, 页码: 80-85
作者:
王久利
;
张鑫
;
王旭乾
;
王丽蓉
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提交时间:2023/12/01
微卫星
多态性
群体遗传
限制性位点相关DNA测序(RAD-seq)
异型花
马氏珠母贝SSR和SNP标记的筛选鉴定与分析
学位论文
OAI收割
硕士: 中科院研究生院, 2013
武善增
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浏览/下载:73/0
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提交时间:2014/12/17
马氏珠母贝
微卫星
单核苷酸多态性位点
遗传多样性
FLDAS-PCR
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:30/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
中国汉族人群中RELN基因rs7341475位点与精神分裂症的相关性分析
期刊论文
OAI收割
动物学研究, 2011, 卷号: 32, 期号: 5, 页码: 499-503
作者:
刘兴彦
;
李明
;
杨顺英
;
宿兵[*]
;
尹利德[*]
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提交时间:2011/12/20
精神分裂症
RELN
单核苷酸多态性位点
中国人群
三峡库区长鳍吻鮈种群遗传多样性的初步研究
期刊论文
OAI收割
水生态学杂志, 2009, 期号: 2
徐念
;
史方
;
熊美华
;
阙延福
;
杨钟
;
朱滨
;
胡菊香
;
常剑波
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提交时间:2010/10/13
微卫星
长鳍吻鮈
三峡库区
种群遗传
多态性位点
栉孔扇贝G-型溶菌酶基因多态性标记筛选及其辅助育种方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200810015048.4, 申请日期: 2008-09-03, 公开日期: 2008-09-03
宋林生
;
李凌
;
赵建民
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浏览/下载:32/0
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提交时间:2014/08/04
1
2)抗病群体和敏感群体的制备
3)抗病相关G-型溶菌酶基因标记的筛选
4)携带抗病相关基因标记个体的快速筛查。1)栉孔扇贝G-型溶菌酶基因启动区部分序列的克隆:参照分子克隆所述方法从栉孔扇贝闭壳肌中提取总DNA
根据已知的G-型溶菌酶基因序列在其启动子区设计引物
即从不同海区和养殖场收集栉孔扇贝个体
PCR扩增42个敏感个体和40个抗病个体的G-型溶菌酶启动区序列后
其中-754ID和-754II个体在抗病群体和敏感群体中出现的频率无显著差别
一种栉孔扇贝抗病相关G-型溶菌酶基因标记
克隆得到一段762个碱基的DNA序列
用病原菌浸泡感染
针对-754TATCTCGATCAGG插入/缺失(I/D)及-391A/G转换分别选用Taq I和Hap II对PCR产物进行酶切
而-391AA个体在敏感群体中出现的频率显著高于抗病群体
其特征在于它的技术内容包括以下四个方面:1)栉孔扇贝G-型溶菌酶基因启动区部分序列的克隆
连入T载体后进行测序
根据死亡时间判断扇贝对病原菌感染抵抗能力
聚丙烯酰胺凝胶电泳后
-391AG个体在抗病群体中出现的频率显著高于敏感群体。因此
获得其核苷酸序列。2)抗病群体和敏感群体的制备:采用人工感染的方法获得抗病群体和敏感群体
将扇贝分为抗病群体和敏感群体。3)抗病相关G-型溶菌酶基因标记的筛选:对来自5个个体的10个克隆进行了测序
各发现两种基因型
将-391AA作为疾病敏感相关的G-型溶菌酶基因标记
发现了10处多态性位点
-754II
而将-391AG作为抗病相关的G-型溶菌酶基因标记。4)携带抗病相关基因标记个体的快速筛查:取栉孔扇贝个体全血1μl作为模版
-754ID
PCR扩增G-型溶菌酶基因启动区序列
-391AA和-391AG
用Hap II对产物进行酶切
聚丙烯酰胺凝胶电泳分型后
选择-391AG个体作为抗病个体。
企鹅珍珠贝同工酶酶谱特征及其遗传分析
期刊论文
OAI收割
水产学报, 2004, 期号: 4
余祥勇,王梅芳,刘永,梁飞龙,毛勇,桂建芳
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提交时间:2010/10/13
企鹅珍珠贝
酶谱特征
位点
多态性
东方田鼠长江亚种和指名亚种基因组DNA序列比较分析
会议论文
OAI收割
2002
许冰
;
胡维新
;
杨榕
;
王勇
;
刘新发
;
彭兴华
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浏览/下载:29/0
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提交时间:2012/05/29
序列比较分析:6583
东方田鼠:5410
指名亚种:4103
基因组DNA:3150
长江:523
生物信息学方法:345
抗日本血吸虫:329
DNA序列分析:215
多态性位点:211
进化规律:188
转pMThGH基因红鲤F_4代鱼体内转植基因存在的分子多态性
期刊论文
OAI收割
科学通报, 2000, 期号: 18
曾志强,朱作言
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浏览/下载:421/45
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提交时间:2010/10/13
转基因鱼
转植基因
分子多态性
整合位点
转人生长激素基因(hGH)红鲤F_4代鱼中转植基因的多态性与整合图式研究
学位论文
OAI收割
博士, 中国科学院水生生物研究所: 中国科学院水生生物研究所, 2000
曾志强
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浏览/下载:266/58
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提交时间:2010/11/16
转基因红鲤
转植基因
分子多态性
整合图式
整合位点