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海洋研究所 [5]
采集方式
OAI收割 [5]
内容类型
专利 [2]
学位论文 [2]
CNKI期刊论文 [1]
发表日期
2020 [1]
2013 [1]
2012 [1]
2008 [2]
学科主题
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共5条,第1-5条
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凡纳滨对虾SNP标记开发与家系亲缘关系验证分析
CNKI期刊论文
OAI收割
2020
作者:
刘峻宇
;
刘均辉
;
孔杰
;
代平
;
于洋
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提交时间:2024/12/18
家系
SNP标记
遗传多样性
聚类分析
亲子鉴定
进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系及应用
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201310340730.1, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
作者:
相建海
;
于洋
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浏览/下载:38/0
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提交时间:2014/08/04
进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系
包括多重微卫星引物体系
其特征在于:使用多态性高的LvM1‑LvM15共15对微卫星引物构成两个多重微卫星引物体系
所述的两个多重微卫星引物体系如下:1)多重微卫星引物体系1的引物序列和荧光标记组合为:LvM1F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑GATGACCTGCCTTTCTCTGC‑3’LvM1R:5’‑GGGAGAGATGATGGGAAGAAG‑3’LvM2F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑ATGGCACAAATAGGATCTTG‑3’LvM2R:5’‑GACTGGAAGAGCACTGATTC‑3’LvM3F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑ATACGAAACACCCCATCCC‑3’LvM3R:5’‑GTGGTCTTACCTCGTGGCTC‑3’LvM4F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑AGCACCTAGCACTTGCTGAAC‑3’LvM4R:5’‑AGAGACTCACATCCTCATCCTC‑3’LvM5F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CATTGAAAACGGAATCCTCG‑3’LvM5R:5’‑GATATTCCCATCAACACAGCG‑3’LvM6F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑CACCAAAACGAACGAAACG‑3’LvM6R:5’‑GGATAAAAACGAATTGTATACCG‑3’LvM7F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GAGAGCAAATAAGAAAGGGC‑3’LvM7R:5’‑AGGATGCAAATGATAACGAG‑3’LvM8F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑GGCACACTGTTTAGTCCTCG‑3’LvM8R:5’‑CGAACAGAATGGCAGAGGAG‑3’LvM9F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CCCGACTTGGCTTTTAGTTG‑3’LvM9R:5’‑GAGATTGCTATCCTCGGCTG‑3’LvM10F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑GATCCTGCGAGTCACTTTATCTC‑3’LvM10R:5’‑TTTATTGCGTATCCCAGAAGC‑3’2)多重微卫星引物体系2的引物和荧光标记组合如下:LvM11F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CCGCCATCATCATCAACA‑3’LvM11R:5’‑TCATTCGGGTTCGAGACTC‑3’LvM12F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑GATCATTCGCCCCTCTTTTT‑3’LvM12R:5’‑ATCTACGGTTCGAGAGCAGA‑3’LvM13F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GGACTCACACTTCTGGTTC‑3’LvM13R:5’‑GGCTGCACCTTGTAAGTC‑3’LvM14F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑TATGCTCGTTCCCTTTGCTT‑3’LvM14R:5’‑TTGAAGGAAAAGTGTTGGGG‑3’LvM15F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑ACTAGTGGATCTGTCTATTCAT‑3’LvM15R:5’‑ATACCCACCCATGCATGTTA‑3’。
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
牙鲆生长相关性状遗传力估计
学位论文
OAI收割
海洋研究所: 中国科学院海洋研究所, 2008
作者:
王晓伟
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提交时间:2010/11/04
牙鲆
生长
遗传力
微卫星
家系鉴定
遗传贡献率
有效群体大小
牙鲆Paralichthys olivaceus(♀)×夏鲆Paralichthys dentaus(♂)分子遗传学及数量遗传学研究
学位论文
OAI收割
海洋研究所: 中国科学院海洋研究所, 2008
作者:
刘清华
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提交时间:2010/11/04
牙鲆(paralichthys Olivaceus)
夏鲆(paralichthys Dentatus)
扩增片段长度多态性(aflp)
杂交
杂种优势
微卫星(ssr)
群体
数量性状
家系
杂交育种
家系鉴定
遗传力