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昆明植物研究所 [1]
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OAI收割 [20]
内容类型
专利 [12]
CNKI期刊论文 [4]
期刊论文 [4]
发表日期
2013 [3]
2012 [2]
2011 [1]
2010 [1]
2009 [2]
2008 [2]
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进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系及应用
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201310340730.1, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
作者:
相建海
;
于洋
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提交时间:2014/08/04
进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系
包括多重微卫星引物体系
其特征在于:使用多态性高的LvM1‑LvM15共15对微卫星引物构成两个多重微卫星引物体系
所述的两个多重微卫星引物体系如下:1)多重微卫星引物体系1的引物序列和荧光标记组合为:LvM1F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑GATGACCTGCCTTTCTCTGC‑3’LvM1R:5’‑GGGAGAGATGATGGGAAGAAG‑3’LvM2F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑ATGGCACAAATAGGATCTTG‑3’LvM2R:5’‑GACTGGAAGAGCACTGATTC‑3’LvM3F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑ATACGAAACACCCCATCCC‑3’LvM3R:5’‑GTGGTCTTACCTCGTGGCTC‑3’LvM4F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑AGCACCTAGCACTTGCTGAAC‑3’LvM4R:5’‑AGAGACTCACATCCTCATCCTC‑3’LvM5F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CATTGAAAACGGAATCCTCG‑3’LvM5R:5’‑GATATTCCCATCAACACAGCG‑3’LvM6F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑CACCAAAACGAACGAAACG‑3’LvM6R:5’‑GGATAAAAACGAATTGTATACCG‑3’LvM7F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GAGAGCAAATAAGAAAGGGC‑3’LvM7R:5’‑AGGATGCAAATGATAACGAG‑3’LvM8F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑GGCACACTGTTTAGTCCTCG‑3’LvM8R:5’‑CGAACAGAATGGCAGAGGAG‑3’LvM9F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CCCGACTTGGCTTTTAGTTG‑3’LvM9R:5’‑GAGATTGCTATCCTCGGCTG‑3’LvM10F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑GATCCTGCGAGTCACTTTATCTC‑3’LvM10R:5’‑TTTATTGCGTATCCCAGAAGC‑3’2)多重微卫星引物体系2的引物和荧光标记组合如下:LvM11F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑CCGCCATCATCATCAACA‑3’LvM11R:5’‑TCATTCGGGTTCGAGACTC‑3’LvM12F:ROX(羧基X罗丹明)‑5’‑GATCATTCGCCCCTCTTTTT‑3’LvM12R:5’‑ATCTACGGTTCGAGAGCAGA‑3’LvM13F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GGACTCACACTTCTGGTTC‑3’LvM13R:5’‑GGCTGCACCTTGTAAGTC‑3’LvM14F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑TATGCTCGTTCCCTTTGCTT‑3’LvM14R:5’‑TTGAAGGAAAAGTGTTGGGG‑3’LvM15F:6‑FAM(羧基荧光素)‑5’‑ACTAGTGGATCTGTCTATTCAT‑3’LvM15R:5’‑ATACCCACCCATGCATGTTA‑3’。
一种累代选育对虾新品种的鉴定方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210384634.2, 申请日期: 2013-01-23, 公开日期: 2013-01-23
作者:
相建海
;
于洋
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提交时间:2014/08/04
一种对累代选育对虾新品种的鉴定方法
将扩增所得线粒体控制区序列符合累代选育群体单倍型的待鉴定群体再利用5对微卫星位点引物进行扩增
而后利用微卫星分型数据进行判别分析
所述5对微卫星位点引物为:引物名序列引物名序列KHv1F5’?TTACCGCCTAAGAGCGAATG?3’KHv1R5’?TGTCCTTTCGTACCAGTCAAG?3’KHv2F5’?GATGTACACAACTGTACTTCG?3’KHv2R5’?GAGATGATAAGAGAACGAAAG?3’KHv3F5’?GAGAGCAAATAAGAAAGGGC?3’KHv3R5’?AGGATGCAAATGATAACGAG?3’KHv4F5’?CGAAGAGATTTATCCAGGG?3’KHv4R5’?CGTGCATTATTATCCTTTCC?3’KHv5F5’?ATGCTGCATCATCTCTGAC?3’KHv5R5’?AGGAAAAGACGGTGAAATAG?3’
其特征在于:采用线粒体控制区的引物扩增并测序待鉴定群体的线粒体控制区
将扩增所的产物进行微卫星分型
进而得到累代选育对虾新品种
文蛤微卫星标记的检测方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
作者:
刘保忠
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提交时间:2014/08/04
文蛤微卫星标记的检测方法
所述特异性引物为正链:5’?TCCCAGGAACGATTGTTAGG?3’
其特征在于:首先利用文蛤EST序列获取微卫星标记的微卫星核心序列
负链:5’?AGCATTCACGACACCAACAT?3’。
并在其序列两端设计特异性引物并进行PCR扩增
对PCR产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
从而检测文蛤个体的基因型
及在此微卫星位点的遗传变异
获得文蛤该位点的遗传多态性图谱
一种牡蛎近缘物种鉴定的方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210189381.3, 申请日期: 2012-10-31, 公开日期: 2012-10-31
王家丰
;
许飞
;
李莉
;
张国范
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提交时间:2014/08/04
一种牡蛎近缘物种鉴定的方法
其特征在于:以牡蛎基因组DNA为模板
根据牡蛎各物种基因组的标签序列设计引物进行PCR扩增
利用扩增产物在高分辨率熔解曲线(High?Resolution?Melting
HRM)中的Tm值差异进而区分牡蛎物种。
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
一种检测迟缓爱德华氏菌、鲇鱼爱德华氏菌或致病性迟缓爱德华氏菌的引物序列及其检测方法和应用
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201010620648.0, 申请日期: 2011-08-03, 公开日期: 2011-08-03
莫照兰
;
李贵阳
;
肖鹏
;
李杰
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提交时间:2014/08/04
一种检测迟缓爱德华氏菌的引物序列
SEQ?ID?NO.2:TCGTTCTGGGTGCAATCC
SEQ?ID?NO.3:CCTGGCGTTCCACCACTATGT
SEQIDNO.4:GCCTTGATGACTATGCCGTTC。
其特征在于:引物序列对SEQ?ID?No.1和SEQ?ID?No.2
SEQ?ID?No.3和SEQ?ID?No.4
所述引物分别为
SEQ?ID?NO.1:GGATGAGGCATCGCGTAAG
一种对虾性别探针及其获取方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200910229806.7, 申请日期: 2010-05-19, 公开日期: 2010-05-19
作者:
相建海
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提交时间:2014/08/04
一种对虾性别探针
包括特异性引物
其特征在于:所述的特异性引物为只能在雄性个体中扩增的引物序列
正向引物:5’-TTGGTTAGATCGGTGAGGAGTC-3’
反向引物:5’-GTGCTGGCGTCAGAGGGTAT-3’。
一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200910020751.9, 申请日期: 2009-12-30, 公开日期: 2009-12-30
作者:
李倩倩
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提交时间:2014/08/04
1.一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统
系统1由7个EST-SSR标记组成
R:CACCAGAAATAATGAGGTTT)
NE12(F:ATGACATTGATGCCTGACG
R:TGCCTTTATTGACCGAGAC)
NE16(F:TTTCACATCCTCCACAGACA
R:GCCACAAGTACACCCAATCA)
NE27(F:ACGGGAAATGGAACAGAT
R:TCCTTCCATCCTGAGTCC)
NE46(F:ACTGCTGTTGTTGGTGGTC
R:CCTTAATCCGTTGCGTCA)
NE48(F:AAAGGTCAGTTAATTTCTTGAT
R:TCTAGTGAAATGACATATTGGT)
NE49(F:AGACCGCTGTTATGCTCCT
R:ATGGGAATGAAGGTTATGTATG)
系统2由6个EST-SSR标记组成
R:CAGAGCCACAACACTAACG)
NE18(F:TATTCAACATTTCAACAACGAT
R:GACGAGCGAAGAACTGGA)
NE23(F:AGAGGCAAATGCGATAAAGA
R:CACGACAGACTTACCAGCAC)
NE25(F:AGGAGGTGCGTAAGAGTGA
R:TTTCCTTCCATCCTGAGTC)
NE26(F:ACGGGAAATGGAACAGAT
R:TCCTTCCATCCTGAGTCC)
NE36(F:ATGTGGACTGCGGGAGA
R:GTGGTGGTAGGTTCGTCTGT)。
其特征在于:所述多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统
扩增7个EST-SSR标记的7对引物分别是NE5(F:CGTGAATGCTGTAGTGTAAT
扩增6个EST-SSR标记的6对引物分别是NE1(F:CATTCCAAGTCTTGACCCC
其中微卫星分子标记系统为由7个EST-SSR标记的系统1和6个EST-SSR标记的系统2组成
一种三疣梭子蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200910015428.2, 申请日期: 2009-10-28, 公开日期: 2009-10-28
崔朝霞
;
王鸿霞
;
谭 烽
;
刘 媛
;
吴丹华
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提交时间:2014/08/04
1.一种三疣梭子蟹多元高通量遗传标记系统
系统1由7个SSR标记组成
R:GTCTTCCACTCCCTTACTGT)
P04(F:GCCACTATCTTGCTGAGGTTGA
R:GCCATAGCACGAACACTTTTGA)
E20(F:CCTCAGGGCAGCTCTGGAT
R:CCCGGACTAGGTGACAGGTT)
E24(F:AACTATGGGTCCTGAGTATTA
R:CTCGGTTTCTGTCCACTT)
C13(F:CTGTCTGATGAGTGAGGCTAC
R:TGACCACGAGGAAAGGAG)
C31(F:TATAAGGGCTTAAGTGTACG
R:GATCTAAACTCAAGGCAAAA)
H4(F:AATCACTTCACTACACCTTTT
R:CTTGATGGGTGGCAGTCT)
系统2由6个SSR标记组成
R:ACAAGATCCTTCGTGGTGGG)
E18(F:CCACAACTGCAAACACCT
R:TTGGCATTTTCATCACTTAC)
E28(F:CGTTACTGAAAGAGTGGTGAA
R:GCAGAGGTTGTACCACCG)
C14(F:AGTGAGATTAACGCAACT
R:CATCTTTCATTACAGGGA)
H13(F:ATGGGCAAGCCTCTTAATGT
R:GGATCTTCGGGTAGGACTGA)
E17(F:ATAAATATCTTGGAAGCCCTCA
R:ACGCCACATAGAACACTCACTC)。
其特征在于:所述多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统
扩增7个SSR标记的7对引物分别是E13(F:AAGGAGGAGGCTTTGATATG
扩增6个SSR标记的6对引物分别是E9(F:TACTGAGACGCCGCTGGTTA
其中微卫星分子标记系统为由7个SSR标记的系统1和6个SSR标记的系统2组成
栉孔扇贝G-型溶菌酶基因多态性标记筛选及其辅助育种方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200810015048.4, 申请日期: 2008-09-03, 公开日期: 2008-09-03
宋林生
;
李凌
;
赵建民
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提交时间:2014/08/04
1
2)抗病群体和敏感群体的制备
3)抗病相关G-型溶菌酶基因标记的筛选
4)携带抗病相关基因标记个体的快速筛查。1)栉孔扇贝G-型溶菌酶基因启动区部分序列的克隆:参照分子克隆所述方法从栉孔扇贝闭壳肌中提取总DNA
根据已知的G-型溶菌酶基因序列在其启动子区设计引物
即从不同海区和养殖场收集栉孔扇贝个体
PCR扩增42个敏感个体和40个抗病个体的G-型溶菌酶启动区序列后
其中-754ID和-754II个体在抗病群体和敏感群体中出现的频率无显著差别
一种栉孔扇贝抗病相关G-型溶菌酶基因标记
克隆得到一段762个碱基的DNA序列
用病原菌浸泡感染
针对-754TATCTCGATCAGG插入/缺失(I/D)及-391A/G转换分别选用Taq I和Hap II对PCR产物进行酶切
而-391AA个体在敏感群体中出现的频率显著高于抗病群体
其特征在于它的技术内容包括以下四个方面:1)栉孔扇贝G-型溶菌酶基因启动区部分序列的克隆
连入T载体后进行测序
根据死亡时间判断扇贝对病原菌感染抵抗能力
聚丙烯酰胺凝胶电泳后
-391AG个体在抗病群体中出现的频率显著高于敏感群体。因此
获得其核苷酸序列。2)抗病群体和敏感群体的制备:采用人工感染的方法获得抗病群体和敏感群体
将扇贝分为抗病群体和敏感群体。3)抗病相关G-型溶菌酶基因标记的筛选:对来自5个个体的10个克隆进行了测序
各发现两种基因型
将-391AA作为疾病敏感相关的G-型溶菌酶基因标记
发现了10处多态性位点
-754II
而将-391AG作为抗病相关的G-型溶菌酶基因标记。4)携带抗病相关基因标记个体的快速筛查:取栉孔扇贝个体全血1μl作为模版
-754ID
PCR扩增G-型溶菌酶基因启动区序列
-391AA和-391AG
用Hap II对产物进行酶切
聚丙烯酰胺凝胶电泳分型后
选择-391AG个体作为抗病个体。