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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
三角帆蚌微卫星富集文库的构建鉴定及多态性分析
期刊论文
OAI收割
中国水产科学, 2010, 卷号: 017, 期号: 006, 页码: 1200
作者:
许巧情
;
谢骏
;
张书环
;
赵朝阳
;
袁汉文
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提交时间:2020/06/03
三角帆蚌
微卫星富集文库
PCR扩增
多态性
海湾扇贝微卫星标记开发及其分离方式分析
CNKI期刊论文
OAI收割
2009
作者:
李宏俊
;
刘晓
;
杜雪地
;
宋蕊
;
张国范
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提交时间:2024/12/18
海湾扇贝(Argopecten irradians)
微卫星
富集文库
无效等位基因
分离方式
海湾扇贝微卫星标记的开发及遗传连锁图谱的构建
学位论文
OAI收割
海洋研究所: 中国科学院海洋研究所, 2009
作者:
李宏俊
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提交时间:2010/11/04
海湾扇贝
微卫星
富集文库
遗传多样性
种群分化
遗传连锁图谱
Qtl
胭脂鱼微卫星富集文库的构建及其应用前景展望
期刊论文
OAI收割
水生态学杂志, 2009, 期号: 2
杨钟
;
史方
;
阙延福
;
熊美华
;
徐念
;
朱滨
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提交时间:2010/10/13
胭脂鱼
微卫星
富集文库
高原鼠兔微卫星富集文库构建与引物筛选
学位论文
OAI收割
硕士, 西北高原生物研究所: 中国科学院西北高原生物研究所, 2007
李克欣
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提交时间:2011/12/20
高原鼠兔
微卫星
富集文库
多态性
等位基因