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OAI收割 [17]
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期刊论文 [8]
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CNKI期刊论文 [2]
学位论文 [2]
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2018 [1]
2017 [1]
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学科主题
天然产物研究 [1]
生物学 [1]
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共17条,第1-10条
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16S/18S/ITS扩增子高通量测序引物的生物信息学评估和改进
期刊论文
OAI收割
微生物学通报, 2020, 卷号: 47, 期号: 09, 页码: 2897-2912
作者:
吴悦妮
;
冯凯
;
厉舒祯
;
王朱珺
;
张照婧
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浏览/下载:49/0
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提交时间:2021/07/16
扩增子测序
16S rRNA基因
ITS基因
18S rRNA基因
PCR扩增
引物
引物覆盖度
引物特异性
扩增产物片段长度
养殖水体三种大型爆发性海洋藻类孢子/配子实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用初探
期刊论文
OAI收割
中国海洋大学学报(自然科学版), 2018, 卷号: 48, 期号: 08, 页码: 68-76
作者:
缪栋
;
苏蕾
;
张倩倩
;
包卫洋
;
龚骏
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浏览/下载:20/0
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提交时间:2020/07/08
藻类爆发
石莼
萱藻
特异性引物
孢子
配子
ITS rDNA
实时荧光定量PCR
海草床底栖原生生物及黄渤海沉积物中纤毛虫的分子生态学研究
学位论文
OAI收割
硕士, 北京: 中国科学院大学, 2017
作者:
苏蕾
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浏览/下载:81/0
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提交时间:2017/06/12
微型真核生物
顶复门
纤毛虫
缘毛类纤毛虫
高通量测序
ITS
特异性引物
分子多样性
群落结构
生物地理学
以RNA为引物的等位基因特异性PCR
学位论文
OAI收割
: 中国科学院大学, 2014
作者:
张玲会
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浏览/下载:37/0
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提交时间:2018/08/28
Rna引物
等位基因特异性pcr
Vent(Exo-)
Taqm1
一种抑食金球藻的快速检测方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201310409553.8, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
宋林生
;
邱丽梅
;
刘瑞
;
张清春
;
张峘
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提交时间:2014/08/04
一种抑食金球藻的快速检测方法
其中
其特征在于:利用抑食金球藻的特异性的引物和探针通过荧光定量PCR扩增及其荧光信号对海水中的抑食金球藻进行检测
特异性的引物和探针分别为:上游引物7365F5‘‑GCGGAGGTCGTGGAGAGG‑3’
下游引物7366R5‘‑GGGTGCGTCCGTAGACTTGA‑3’
探针:5‘‑CTCGGCTTCACGGGCGGCTTCC‑3’。
扇贝致病性灿烂弧菌Vibrio splendidus的快速检测方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201310409878.6, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
宋林生
;
邱丽梅
;
刘瑞
;
张峘
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浏览/下载:107/0
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提交时间:2014/08/04
一种扇贝致病性灿烂弧菌Vibrio splendidus的快速检测方法
其中所述的引物为:16S rDNA:上游引物16Srtf:5’‑AGAACCTTACCTACTCTTGACATCC‑3’
金属蛋白酶基因:上游引物spf1:5’‑ATGGCACAAGGGATCAGCGG‑3’
其特征在于:以待检测的过滤海水样品中细菌基因组总DNA为模版
下游引物16Srtr:5’‑CCCAACATTTCACAACACGA‑3’
下游引物spf2:5’‑GGATAAGAGGAAGCGATAAAGAA‑3’。
利用细菌16SrDNA保守区域和致病性灿烂弧菌金属蛋白酶基因的特异性的引物进行荧光定量PCR扩增和定量分析检测养殖环境中扇贝致病性灿烂弧菌Vibrio splendidus
类群特异性PCR引物设计与评估
期刊论文
OAI收割
生物信息学, 2013, 期号: 2, 页码: 79-85
作者:
宋秀贤
;
俞志明
;
曹西华
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提交时间:2014/07/28
类群特异性PCR引物
真核藻类
Primrose
18S rDNA通用引物
类群特异性PCR引物设计与评估
CNKI期刊论文
OAI收割
2013
作者:
董声
;
俞志明
;
宋秀贤
;
韩笑天
;
曹西华
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提交时间:2024/12/18
类群特异性PCR引物
真核藻类
Primrose
18S rDNA通用引物
文蛤微卫星标记的检测方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
作者:
刘保忠
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提交时间:2014/08/04
文蛤微卫星标记的检测方法
所述特异性引物为正链:5’?TCCCAGGAACGATTGTTAGG?3’
其特征在于:首先利用文蛤EST序列获取微卫星标记的微卫星核心序列
负链:5’?AGCATTCACGACACCAACAT?3’。
并在其序列两端设计特异性引物并进行PCR扩增
对PCR产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
从而检测文蛤个体的基因型
及在此微卫星位点的遗传变异
获得文蛤该位点的遗传多态性图谱
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:30/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。