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家猪毛色和窝产仔数性状的群体基因组学研究
学位论文
OAI收割
北京: 中国科学院大学, 2018
作者:
吕梦蝶
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提交时间:2020/12/15
滇南小耳猪,大白猪,六白毛色,窝产仔数,群体基因组学
dse Pigs, Large White Pigs, six-White-pointed Pigmentation,Population Genomics
转录组学和基因组学水平解析家鸡复杂性状分子遗传机制
学位论文
OAI收割
北京: 中国科学院大学, 2018
作者:
王运梅
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浏览/下载:48/0
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提交时间:2020/12/15
转录组学,群体基因组学,驯化,基因间长链非编码Rna,Rna编辑
transcriptomics, Population Genomics, Domestication, Long Intergenic Non-coding Rna, Rna Editing
小黄鱼和日本鳗鲡群体遗传结构及本地适应性研究
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院大学, 2017
作者:
刘炳舰
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提交时间:2017/06/05
小黄鱼
日本鳗鲡
群体遗传结构
群体基因组
本地适应性
松江鲈遗传标记开发与保护遗传学研究
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院大学, 2017
作者:
李玉龙
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提交时间:2017/06/06
保护遗传学
群体基因组学
RAD-seq
松江鲈
遗传结构
本地适应性
中国近海小黄鱼SNP标记开发及种群基因组学研究
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院大学, 2016
作者:
张柏东
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提交时间:2016/06/01
小黄鱼
单核苷酸多态性标记
RAD-seq
群体遗传结构
本地适应性
种群基因组学
报春苣苔属牛耳朵复合体谱系地理学和群体基因组学研究
学位论文
OAI收割
北京: 中国科学院大学, 2015
作者:
高永
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提交时间:2018/12/23
喀斯特
报春苣苔属
叶绿体DNA
谱系地理学
群体基因组学
SNP
青藏高原青稞及野生大麦群体结构和标记/性状全基因组关联分析
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2014
王 蕾
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提交时间:2014/09/04
青稞
遗传多样性
群体结构
连锁不平衡
全基因组关联分析
不同尺度下物进化的基因组学研究
学位论文
OAI收割
硕士, 北京: 中国科学院研究生院, 2013
作者:
宋卢挺
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浏览/下载:27/0
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提交时间:2014/06/06
动物进化
基因组学
进化基因组学
肿瘤细胞群体
单细胞序列
中国板栗自然居群群体遗传学及栗疫病抗性相关群体基因组学研究
学位论文
OAI收割
北京: 中国科学院大学, 2013
作者:
刘伟
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浏览/下载:22/0
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提交时间:2018/12/23
中国板栗
遗传结构
栗疫病
群体基因组学
EST-SNP
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:36/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。