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海洋研究所 [1]
采集方式
OAI收割 [8]
内容类型
期刊论文 [5]
学位论文 [2]
专利 [1]
发表日期
2012 [1]
2011 [2]
2010 [2]
2009 [3]
学科主题
环境生物学 [1]
环境科学::环境化学 [1]
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共8条,第1-8条
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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:30/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
冬季太湖表层底泥产毒蓝藻群落结构和种群丰度
期刊论文
OAI收割
生态学报, 2011, 期号: 21, 页码: 6551-6560
李大命
;
孔繁翔
;
于洋
;
阳振
;
史小丽
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提交时间:2012/03/13
荧光定量PCR
有毒蓝藻
群落结构
变性梯度凝胶电泳
太湖
太湖夏季蓝藻水华期间产毒蓝藻基因型组成和种群丰度研究
期刊论文
OAI收割
农业环境科学学报, 2011, 期号: 6, 页码: 1135-1143
作者:
李大命
;
孔繁翔
;
叶琳琳
;
于洋
;
张民
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浏览/下载:14/0
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提交时间:2012/03/10
蓝藻水华
定量pcr
变性梯度凝胶电泳
微囊藻毒素
太湖
两种常用农药对叶际微生物群落结构的影响及叶面农药残留的原位降解研究
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2010
宁洎英
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浏览/下载:219/0
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提交时间:2011/04/19
敌敌畏降解
叶际微生物群落
聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳
有机磷农药
黄杆菌属
原位修复
吡虫啉 Dichlorvos biodegradation
phyllosphere microbial community
PCR-DGGE
organophosphorus pesticide
Flavobacterium sp.
in situ bioremediation
imidacloprid
基于引物的湖泊沉积物氨氧化细菌PCR扩增策略比较
期刊论文
OAI收割
环境科学, 2010, 期号: 9, 页码: 2178-2183
作者:
吴宇澄
;
王建军
;
吴庆龙
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浏览/下载:9/0
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提交时间:2012/03/14
氨氧化细菌
Pcr
引物
变性梯度凝胶电泳
沉积物
水稻土中硫酸盐还原微生物研究进展
期刊论文
OAI收割
生态学报, 2009, 期号: 8, 页码: 4455-4463
刘新展
;
贺纪正
;
张丽梅
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浏览/下载:53/0
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提交时间:2012/07/04
水稻土
硫循环
硫酸盐还原菌
末端限制性片段长度多态性
变性梯度凝胶电泳
实时荧光定量PCR
荧光原位杂交
典型红壤和水稻土中甲烷营养菌的分子生态学特征
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2009
郑勇
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浏览/下载:60/0
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提交时间:2010/06/07
甲烷营养菌
水稻土
旱地红壤
长期施肥
土地利用方式
丰度
群 落结构
CH4 氧化速率
pmoA
16S rRNA
变性梯度凝胶电泳
实时荧光定量 PCR Methanotroph
Paddy soil
Upland red soil
Long-term fertilization
Land utilization pattern
Abundance
Community structure
Methane oxidation rate
Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)
real-time PCR
滤食性鲢、鳙肠含物PCR-DGGE指纹分析
期刊论文
OAI收割
水产学报, 2009, 期号: 6
颜庆云
;
余育和
;
张堂林
;
冯伟松
;
李学梅
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提交时间:2010/10/13
鲢
鳙
PCR-变性梯度凝胶电泳
肠含物
武汉东湖