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专利 [2]
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发表日期
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2020 [1]
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2015 [2]
2013 [1]
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学科主题
深海微生物 [1]
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共20条,第1-10条
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大洋表层沉积物中甲烷代谢古菌群落的组成及分布特征
期刊论文
OAI收割
海洋学报, 海洋学报, 2023, 2023, 卷号: 45, 45, 期号: 1, 页码: 80-88, 80-88
作者:
刘皓
;
许秋彤
;
王春生
;
荆红梅
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浏览/下载:17/0
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提交时间:2023/04/13
大洋表层沉积物
大洋表层沉积物
甲烷代谢古菌
mcrA基因
高通量测序
实时定量PCR
甲烷代谢古菌
mcrA基因
高通量测序
实时定量PCR
16S/18S/ITS扩增子高通量测序引物的生物信息学评估和改进
期刊论文
OAI收割
微生物学通报, 2020, 卷号: 47, 期号: 09, 页码: 2897-2912
作者:
吴悦妮
;
冯凯
;
厉舒祯
;
王朱珺
;
张照婧
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浏览/下载:49/0
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提交时间:2021/07/16
扩增子测序
16S rRNA基因
ITS基因
18S rRNA基因
PCR扩增
引物
引物覆盖度
引物特异性
扩增产物片段长度
大洋沉积物中甲烷代谢微生物群落的组成及分布特征
学位论文
OAI收割
深海科学与工程研究所: 中国科学院大学, 2018
作者:
许秋彤
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浏览/下载:21/0
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提交时间:2021/01/15
大洋沉积物
甲烷代谢微生物
群落结构
高通量测序
荧光实时定量PCR
典型生态系统土壤微生物分布特征及生态学机制
学位论文
OAI收割
博士后, 北京: 中国科学院研究生院, 2015
作者:
曹鹏
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浏览/下载:950/0
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提交时间:2016/07/08
土壤古菌,土壤细菌,群落组成和分布特征,生态系统类型,扩散限制, 环境筛选,生态位理论,中性理论,空间因子,环境因子,结构方程模型,荧光 实时定量 PCR,高通量测序, soil archaea, soil bacteria, community composition and distribution, ecosystem types, dispersal limitation, environmental filting, niche theory, neutral theory, spatial factors, environmental factors, Structural Equation Modeling, real-time PCR, high-throughput sequencing
氮肥与双氰胺对土壤中氨氧化和甲烷氧化等微生物的影响
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2013
戴宇
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浏览/下载:210/0
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提交时间:2014/07/07
氮肥
硝化抑制剂双氰胺
氨氧化微生物
甲烷氧化菌
实时荧光定量PCR
N2O和CH4气体排放量
454焦磷酸测序
田间试验
室内培养实验
nitrogen fertilizer
a nitrification inhibitor dicyandiamide
ammonia oxidizing microorganisms
methanotroph
real-time quantitative PCR
N2O and CH4 emissions
454 pyrosequencing
field experiment
indoor cultivation experiment
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:
刘保忠
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浏览/下载:30/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物
GC含量为40%?60%
退火温度为45?65℃
预期PCR产物长度为100?400bp
3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量
包括微卫星位点来源
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
在Tm值上下各10℃
根据上述优化获得的Ta值
引物设计
温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息
引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
选取杂带较少
根据PIC值
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA
特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta
PIC小于0.25的标记
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段
筛选得到重复性好
并构建微卫星磁珠富集文库
稳定性好
检测阳性克隆
PIC值大于0.25的位点
经测序得到含有微卫星重复的DNA序列
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
我国代表性水稻土中微生物多样性的焦磷酸测序法研究
学位论文
OAI收割
硕士, 北京: 中国科学院研究生院, 2012
袁超磊
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提交时间:2014/05/13
水稻土
定量 PCR
焦磷酸测序
微生物群落
古菌
细菌
真菌
paddy soil
microbial community
qPCR
pyrosequencing
bacteria
archaea
fungi
土壤古菌的多尺度分布特征及其生态学机制
学位论文
OAI收割
博士, 北京: 中国科学院研究生院, 2012
曹鹏
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浏览/下载:91/0
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提交时间:2013/12/19
土壤古菌
土壤细菌
群落组成和分布特征
多尺度
生态位理论
中性理论
空间因子
环境因子
物种多度拟合模型
荧光实时定量PCR
末端限制性片段多态性
克隆和测序
soil archaea
soil bacteria
community composition and distribution
multiple scale
niche theory
neutraltheory
spatial factors
environmental factors
species abundance fitting models
real-time PCR
terminal restriction fragment length polymorphism
cloning and sequencing
应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列
CNKI期刊论文
OAI收割
2012
作者:
申欣
;
田美
;
朱长保
;
刘会莲
;
赵方庆
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浏览/下载:3/0
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提交时间:2024/12/18
大室别藻苔虫
线粒体基因组
新一代测序技术
巢式PCR
基因排列