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Deciphering molecular mechanism behind conformational change of the Sao Paolo metallo-beta-lactamase 1 by using enhanced sampling
期刊论文
OAI收割
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2019, 页码: 12
作者:
Chen, Jianzhong
;
Wang, Jinan
;
Pang, Laixue
;
Wang, Wei
;
Zhao, Juan
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提交时间:2020/07/01
Sao paolo metallo-beta-lactamase-1
REMD simulations
normal mode analysis
principal component analysis
drug resistance of antibiotics
Application of normal Morlet wavelet transform method to the damped harmonic analysis: On the isolation of the seismic normal modes (S-0(0) and S-0(5)) in time domain
期刊论文
OAI收割
PHYSICS OF THE EARTH AND PLANETARY INTERIORS, 2019, 卷号: 288, 页码: 26-36
作者:
Duan, Pengshuo
;
Huang, Chengli
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提交时间:2019/05/23
Seismic normal mode
NMWT method
Beating-frequency behaviors
Earth's free oscillation
Wavelet analysis
Exploring molecular mechanism of allosteric inhibitor to relieve drug resistance of multiple mutations in HIV-1 protease by enhanced conformational sampling
期刊论文
OAI收割
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 86, 期号: 12, 页码: 1294-1305
作者:
Chen, Jianzhong
;
Peng, Cheng
;
Wang, Jinan
;
Zhu, Weiliang
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浏览/下载:70/0
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提交时间:2019/01/08
allosteric inhibitor
HIV-1 protease
MM-GBSA
normal mode analysis
REMD
Fast and Accurate Computation Schemes for Evaluating Vibrational Entropy of Proteins
期刊论文
OAI收割
journal of computational chemistry, 2011, 卷号: 32, 期号: 15, 页码: 3188-3193
作者:
Xu, Beisi
;
Shen, Hujun
;
Zhu, Xiao
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提交时间:2015/11/12
normal mode analysis
vibrational entropy
coarse-grained NMA
Inherent Dynamics of the Acid-Sensing Ion Channel 1 Correlates with the Gating Mechanism
期刊论文
OAI收割
PLOS BIOLOGY, 2009, 卷号: 7, 期号: 7, 页码: e1000151-e1000152
Yang, Huaiyu
;
Yu, Ye
;
Li, Wei-Guang
;
Yu, Fang
;
Cao, Hui
;
Xu, Tian-Le(徐天乐)
;
Jiang, Hualiang
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提交时间:2012/07/13
NORMAL-MODE ANALYSIS
NICOTINIC ACETYLCHOLINE-RECEPTOR
EPITHELIAL NA+ CHANNEL
SINGLE-PARAMETER
PROTEINS
CONTRIBUTES
FLEXIBILITY
SELECTIVITY
PERMEATION
MOTIONS
Sequential deprotonation of meso-(p-hydroxyphenyl)porphyrins in DMF: From hyperporphyrins to sodium porphyrin complexes
期刊论文
OAI收割
journal of physical chemistry b, 2006, 卷号: 110, 期号: 1, 页码: 587-594
Guo HW
;
Jiang JG
;
Shi YY
;
Wang YL
;
Wang YZ
;
Dong SJ
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提交时间:2010/08/17
ACID DISSOCIATION-CONSTANTS
MAGNETIC RESONANCE SPECTRA
ORGANIC-SOLVENT MIXTURES
NORMAL-MODE ANALYSIS
TETRAPHENYLPORPHYRIN MOLECULES
ELECTRONIC-SPECTRA
RADICAL CATIONS
EXCITED-STATES
SHIFTS
RAMAN
The density of states in liquid RbCl
期刊论文
OAI收割
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA, 2004, 卷号: 20, 期号: 5, 页码: 494-497
He, XH
;
Tang, ZQ
;
Cheng, ZN
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提交时间:2012/03/24
NORMAL-MODE ANALYSIS
SIMULATION
DIFFUSION
Dynamics of stiff chain
期刊论文
OAI收割
EUROPEAN POLYMER JOURNAL, 2001, 卷号: 37, 期号: 6, 页码: 1277-1281
作者:
Zhang, LX
;
Xia, A
;
Zhao, DL
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提交时间:2019/04/09
Stiff Chain
Normal Mode Analysis
Dynamics