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鲽形目鱼类核糖体RNA基因序列特征研究及其在鲽形目系统进化中的应用 学位论文 OAI收割
: 南海海洋研究所, 2019
作者: 杨敏

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序列多态性，非协同进化，假基因，重组，系统分类

5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性 期刊论文 OAI收割
水产学报, 2018, 卷号: 42, 期号: 04, 页码: 465-475
作者: 武宝生; 司李真; 孔晓瑜; 时伟; 杨敏

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鲈形目鲹科 ITS1序列多态性系统演化假基因

山地虎耳草和棒腺虎耳草转录组SSR和SNP分析 期刊论文 OAI收割
西北植物学报, 2018, 卷号: 38, 期号: 07, 页码: 1244-1253
作者: 高庆波; 陈世龙; 王智华; 贾留坤; 更吉卓玛

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山地虎耳草棒腺虎耳草转录组简单重复序列(SSR) 单核苷酸多态性(SNP)

环境变化对纤毛虫原生生物核糖体RNA基因SNP、拷贝数及其表达的影响 学位论文 OAI收割
博士, 北京: 中国科学院大学, 2017
作者: 付娆

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纤毛虫原生生物温度环境污染物生长速率细胞大小 18S rDNA/RNA分子标记拷贝数变化序列多态性

基于高通量测序技术的虎杖EST-SSRs和EST-SNPs的开发及特征分析 期刊论文 OAI收割
中药材, 2015, 卷号: 38, 期号: 06, 页码: 1164-1167
作者: 欧阳蒲月; 刘芬; 夏黎; 胡伟明(3; 4)

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虎杖转录组简单重复序列单核苷酸多态性

进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系及应用 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201310340730.1, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
作者: 相建海; 于洋

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进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系包括多重微卫星引物体系其特征在于：使用多态性高的LvM1‑LvM15共15对微卫星引物构成两个多重微卫星引物体系所述的两个多重微卫星引物体系如下：1）多重微卫星引物体系1的引物序列和荧光标记组合为：LvM1F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑GATGACCTGCCTTTCTCTGC‑3’LvM1R:5’‑GGGAGAGATGATGGGAAGAAG‑3’LvM2F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑ATGGCACAAATAGGATCTTG‑3’LvM2R:5’‑GACTGGAAGAGCACTGATTC‑3’LvM3F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑ATACGAAACACCCCATCCC‑3’LvM3R:5’‑GTGGTCTTACCTCGTGGCTC‑3’LvM4F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑AGCACCTAGCACTTGCTGAAC‑3’LvM4R:5’‑AGAGACTCACATCCTCATCCTC‑3’LvM5F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑CATTGAAAACGGAATCCTCG‑3’LvM5R:5’‑GATATTCCCATCAACACAGCG‑3’LvM6F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑CACCAAAACGAACGAAACG‑3’LvM6R:5’‑GGATAAAAACGAATTGTATACCG‑3’LvM7F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GAGAGCAAATAAGAAAGGGC‑3’LvM7R:5’‑AGGATGCAAATGATAACGAG‑3’LvM8F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑GGCACACTGTTTAGTCCTCG‑3’LvM8R:5’‑CGAACAGAATGGCAGAGGAG‑3’LvM9F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑CCCGACTTGGCTTTTAGTTG‑3’LvM9R:5’‑GAGATTGCTATCCTCGGCTG‑3’LvM10F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑GATCCTGCGAGTCACTTTATCTC‑3’LvM10R:5’‑TTTATTGCGTATCCCAGAAGC‑3’2）多重微卫星引物体系2的引物和荧光标记组合如下：LvM11F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑CCGCCATCATCATCAACA‑3’LvM11R:5’‑TCATTCGGGTTCGAGACTC‑3’LvM12F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑GATCATTCGCCCCTCTTTTT‑3’LvM12R:5’‑ATCTACGGTTCGAGAGCAGA‑3’LvM13F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GGACTCACACTTCTGGTTC‑3’LvM13R:5’‑GGCTGCACCTTGTAAGTC‑3’LvM14F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑TATGCTCGTTCCCTTTGCTT‑3’LvM14R:5’‑TTGAAGGAAAAGTGTTGGGG‑3’LvM15F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑ACTAGTGGATCTGTCTATTCAT‑3’LvM15R:5’‑ATACCCACCCATGCATGTTA‑3’。

文蛤微卫星标记的检测方法 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
作者: 刘保忠

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文蛤微卫星标记的检测方法所述特异性引物为正链：5’?TCCCAGGAACGATTGTTAGG?3’ 其特征在于：首先利用文蛤EST序列获取微卫星标记的微卫星核心序列负链：5’?AGCATTCACGACACCAACAT?3’。并在其序列两端设计特异性引物并进行PCR扩增对PCR产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测从而检测文蛤个体的基因型及在此微卫星位点的遗传变异获得文蛤该位点的遗传多态性图谱

一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者: 刘保忠

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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 2)引物设计：在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物 GC含量为40％?60％退火温度为45?65℃ 预期PCR产物长度为100?400bp 3)引物优化：根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化 4)微卫星标记家系鉴定体系的确立：微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量包括微卫星位点来源引物设计条件为：引物长度为19?25mer 在Tm值上下各10℃ 根据上述优化获得的Ta值引物设计温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息引物优化和微卫星标记家系鉴定体系选取杂带较少根据PIC值其特征在于：1)微卫星位点的来源：提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA 特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta PIC小于0.25的标记采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段筛选得到重复性好并构建微卫星磁珠富集文库稳定性好检测阳性克隆 PIC值大于0.25的位点经测序得到含有微卫星重复的DNA序列作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系用于文蛤的家系区分与个体识别。

栉孔扇贝（Chlamys farreri）BAC末端序列中SSR和SNP分子标记的开发及初步应用研究 学位论文 OAI收割
硕士: 中国科学院研究生院, 2012
张秀英

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栉孔扇贝（Chlamys farreri） BAC末端序列（BESs）分子标记简单重复序列（SSR）单核苷酸多态性（SNP）

基于EST数据库进行SNP分子标记开发的研究进展及在猕猴桃属植物中的应用研究 期刊论文 OAI收割
热带亚热带植物学报, 2011, 卷号: 19, 期号: 02, 页码: 184-194
作者: 周锦; 刘义飞; 黄宏文

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生物信息学猕猴桃遗传多样性表达序列标签单核苷酸多态性