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海带转录组SSR序列特征及其相关基因功能分析 CNKI期刊论文 OAI收割
2016
作者: 李秋莹; 张杰; 姚建亭; 王秀良; 段德麟

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微卫星转录组简单序列重复(SSR) 海带(Saccharina japonica)

进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系及应用 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201310340730.1, 申请日期: 2013-12-25, 公开日期: 2013-12-25
作者: 相建海; 于洋

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进行凡纳滨对虾家系鉴定的多重微卫星鉴定体系包括多重微卫星引物体系其特征在于：使用多态性高的LvM1‑LvM15共15对微卫星引物构成两个多重微卫星引物体系所述的两个多重微卫星引物体系如下：1）多重微卫星引物体系1的引物序列和荧光标记组合为：LvM1F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑GATGACCTGCCTTTCTCTGC‑3’LvM1R:5’‑GGGAGAGATGATGGGAAGAAG‑3’LvM2F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑ATGGCACAAATAGGATCTTG‑3’LvM2R:5’‑GACTGGAAGAGCACTGATTC‑3’LvM3F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑ATACGAAACACCCCATCCC‑3’LvM3R:5’‑GTGGTCTTACCTCGTGGCTC‑3’LvM4F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑AGCACCTAGCACTTGCTGAAC‑3’LvM4R:5’‑AGAGACTCACATCCTCATCCTC‑3’LvM5F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑CATTGAAAACGGAATCCTCG‑3’LvM5R:5’‑GATATTCCCATCAACACAGCG‑3’LvM6F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑CACCAAAACGAACGAAACG‑3’LvM6R:5’‑GGATAAAAACGAATTGTATACCG‑3’LvM7F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GAGAGCAAATAAGAAAGGGC‑3’LvM7R:5’‑AGGATGCAAATGATAACGAG‑3’LvM8F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑GGCACACTGTTTAGTCCTCG‑3’LvM8R:5’‑CGAACAGAATGGCAGAGGAG‑3’LvM9F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑CCCGACTTGGCTTTTAGTTG‑3’LvM9R:5’‑GAGATTGCTATCCTCGGCTG‑3’LvM10F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑GATCCTGCGAGTCACTTTATCTC‑3’LvM10R:5’‑TTTATTGCGTATCCCAGAAGC‑3’2）多重微卫星引物体系2的引物和荧光标记组合如下：LvM11F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑CCGCCATCATCATCAACA‑3’LvM11R:5’‑TCATTCGGGTTCGAGACTC‑3’LvM12F:ROX（羧基X罗丹明）‑5’‑GATCATTCGCCCCTCTTTTT‑3’LvM12R:5’‑ATCTACGGTTCGAGAGCAGA‑3’LvM13F:HEX(六氯荧光素)‑5’‑GGACTCACACTTCTGGTTC‑3’LvM13R:5’‑GGCTGCACCTTGTAAGTC‑3’LvM14F:TAMRA(羧基四甲基罗丹明)‑5’‑TATGCTCGTTCCCTTTGCTT‑3’LvM14R:5’‑TTGAAGGAAAAGTGTTGGGG‑3’LvM15F:6‑FAM（羧基荧光素）‑5’‑ACTAGTGGATCTGTCTATTCAT‑3’LvM15R:5’‑ATACCCACCCATGCATGTTA‑3’。

一种累代选育对虾新品种的鉴定方法 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210384634.2, 申请日期: 2013-01-23, 公开日期: 2013-01-23
作者: 相建海; 于洋

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一种对累代选育对虾新品种的鉴定方法将扩增所得线粒体控制区序列符合累代选育群体单倍型的待鉴定群体再利用5对微卫星位点引物进行扩增而后利用微卫星分型数据进行判别分析所述5对微卫星位点引物为：引物名序列引物名序列KHv1F5’?TTACCGCCTAAGAGCGAATG?3’KHv1R5’?TGTCCTTTCGTACCAGTCAAG?3’KHv2F5’?GATGTACACAACTGTACTTCG?3’KHv2R5’?GAGATGATAAGAGAACGAAAG?3’KHv3F5’?GAGAGCAAATAAGAAAGGGC?3’KHv3R5’?AGGATGCAAATGATAACGAG?3’KHv4F5’?CGAAGAGATTTATCCAGGG?3’KHv4R5’?CGTGCATTATTATCCTTTCC?3’KHv5F5’?ATGCTGCATCATCTCTGAC?3’KHv5R5’?AGGAAAAGACGGTGAAATAG?3’ 其特征在于：采用线粒体控制区的引物扩增并测序待鉴定群体的线粒体控制区将扩增所的产物进行微卫星分型进而得到累代选育对虾新品种

文蛤微卫星标记的检测方法 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
作者:

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文蛤微卫星标记的检测方法所述特异性引物为正链：5’?TCCCAGGAACGATTGTTAGG?3’ 其特征在于：首先利用文蛤EST序列获取微卫星标记的微卫星核心序列负链：5’?AGCATTCACGACACCAACAT?3’。并在其序列两端设计特异性引物并进行PCR扩增对PCR产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测从而检测文蛤个体的基因型及在此微卫星位点的遗传变异获得文蛤该位点的遗传多态性图谱

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表达序列标签基因组微卫星种间通用性种群遗传学分析松属植物长白山

一种区分长心卡帕藻与细齿麒麟菜的微卫星标记及其特异性引物和应用 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210249152.6, 申请日期: 2012-10-31, 公开日期: 2012-10-31
张振; 刘建国; 庞通; 李凌; 林伟

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一种区分长心卡帕藻与细齿麒麟菜的微卫星标记细齿麒麟菜的微卫星标记为SEQ.ID.NO6?10碱基序列所示。其特征在于：长心卡帕藻微卫星标记为SEQ.ID.NO1?5碱基序列所示

一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者: 刘保忠

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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 2)引物设计：在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物 GC含量为40％?60％退火温度为45?65℃ 预期PCR产物长度为100?400bp 3)引物优化：根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化 4)微卫星标记家系鉴定体系的确立：微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量包括微卫星位点来源引物设计条件为：引物长度为19?25mer 在Tm值上下各10℃ 根据上述优化获得的Ta值引物设计温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息引物优化和微卫星标记家系鉴定体系选取杂带较少根据PIC值其特征在于：1)微卫星位点的来源：提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA 特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta PIC小于0.25的标记采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段筛选得到重复性好并构建微卫星磁珠富集文库稳定性好检测阳性克隆 PIC值大于0.25的位点经测序得到含有微卫星重复的DNA序列作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系用于文蛤的家系区分与个体识别。

栉孔扇贝BES-SSR的开发及遗传多样性分析 CNKI期刊论文 OAI收割
2012
作者: 张秀英; 张晓军; 赵翠; 常亚青; 郇聘

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栉孔扇贝 BAC末端序列微卫星遗传多样性

栉孔扇贝BES-SSR的开发及遗传多样性分析 期刊论文 OAI收割
水产学报, 2012, 期号: 6, 页码: 815-824
作者: 相建海; 郇聘

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栉孔扇贝 BAC末端序列微卫星遗传多样性

一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法 专利 OAI收割
专利类型: 发明, 专利号: CN200910020751.9, 申请日期: 2009-12-30, 公开日期: 2009-12-30
作者: 李倩倩

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1.一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统系统1由7个EST-SSR标记组成 R：CACCAGAAATAATGAGGTTT) NE12(F：ATGACATTGATGCCTGACG R：TGCCTTTATTGACCGAGAC) NE16(F：TTTCACATCCTCCACAGACA R：GCCACAAGTACACCCAATCA) NE27(F：ACGGGAAATGGAACAGAT R：TCCTTCCATCCTGAGTCC) NE46(F：ACTGCTGTTGTTGGTGGTC R：CCTTAATCCGTTGCGTCA) NE48(F：AAAGGTCAGTTAATTTCTTGAT R：TCTAGTGAAATGACATATTGGT) NE49(F：AGACCGCTGTTATGCTCCT R：ATGGGAATGAAGGTTATGTATG) 系统2由6个EST-SSR标记组成 R：CAGAGCCACAACACTAACG) NE18(F：TATTCAACATTTCAACAACGAT R：GACGAGCGAAGAACTGGA) NE23(F：AGAGGCAAATGCGATAAAGA R：CACGACAGACTTACCAGCAC) NE25(F：AGGAGGTGCGTAAGAGTGA R：TTTCCTTCCATCCTGAGTC) NE26(F：ACGGGAAATGGAACAGAT R：TCCTTCCATCCTGAGTCC) NE36(F：ATGTGGACTGCGGGAGA R：GTGGTGGTAGGTTCGTCTGT)。其特征在于：所述多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统扩增7个EST-SSR标记的7对引物分别是NE5(F：CGTGAATGCTGTAGTGTAAT 扩增6个EST-SSR标记的6对引物分别是NE1(F：CATTCCAAGTCTTGACCCC 其中微卫星分子标记系统为由7个EST-SSR标记的系统1和6个EST-SSR标记的系统2组成